Protein–RNA interactions for Protein: Q62186

Ssr4, Translocon-associated protein subunit delta, mousemouse

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Length 172 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssr4Q62186 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ssr4Q62186 Ube2v2-202ENSMUST00000115776 1236 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ssr4Q62186 Rian-216ENSMUST00000183215 880 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ssr4Q62186 Gm40123-201ENSMUST00000198175 1027 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ssr4Q62186 Gm5628-201ENSMUST00000222318 1049 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Ssr4Q62186 Alkbh7-201ENSMUST00000002737 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ssr4Q62186 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ssr4Q62186 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ssr4Q62186 Tsc22d3-203ENSMUST00000112996 1552 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ssr4Q62186 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ssr4Q62186 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ssr4Q62186 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ssr4Q62186 Gps1-208ENSMUST00000208737 1843 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ssr4Q62186 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ssr4Q62186 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ssr4Q62186 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ssr4Q62186 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ssr4Q62186 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ssr4Q62186 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ssr4Q62186 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ssr4Q62186 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ssr4Q62186 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Ssr4Q62186 1700045H11Rik-201ENSMUST00000128056 593 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ssr4Q62186 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ssr4Q62186 Gm18889-201ENSMUST00000174284 929 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Ssr4Q62186 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ssr4Q62186 6030443J06Rik-204ENSMUST00000195898 786 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ssr4Q62186 AC140397.2-201ENSMUST00000224213 834 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Ssr4Q62186 Ccdc172-201ENSMUST00000069419 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ssr4Q62186 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ssr4Q62186 Lpar5-203ENSMUST00000171989 1458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ssr4Q62186 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ssr4Q62186 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ssr4Q62186 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ssr4Q62186 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ssr4Q62186 Fam170b-201ENSMUST00000104926 1694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ssr4Q62186 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ssr4Q62186 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ssr4Q62186 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ssr4Q62186 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ssr4Q62186 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Ssr4Q62186 Sirt5-211ENSMUST00000223194 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ssr4Q62186 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ssr4Q62186 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
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Ssr4Q62186 Rerg-203ENSMUST00000119610 890 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ssr4Q62186 Tspan5-203ENSMUST00000121826 1114 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ssr4Q62186 Mpped1-210ENSMUST00000172115 795 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ssr4Q62186 Mpped1-211ENSMUST00000172398 795 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
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Ssr4Q62186 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ssr4Q62186 1700086L19Rik-202ENSMUST00000185822 1028 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
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Ssr4Q62186 Gm10747-201ENSMUST00000217799 1014 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ssr4Q62186 Aga-201ENSMUST00000033920 1181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ssr4Q62186 Gpr146-202ENSMUST00000053120 1040 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Ssr4Q62186 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ssr4Q62186 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ssr4Q62186 Dcun1d3-203ENSMUST00000106519 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ssr4Q62186 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ssr4Q62186 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ssr4Q62186 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ssr4Q62186 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ssr4Q62186 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ssr4Q62186 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
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Ssr4Q62186 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ssr4Q62186 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ssr4Q62186 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ssr4Q62186 Gm26728-202ENSMUST00000203423 1333 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
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Ssr4Q62186 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC16■□□□□ 0.15
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Ssr4Q62186 Mlnr-ps-201ENSMUST00000208959 969 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Ssr4Q62186 AC131187.1-201ENSMUST00000224567 809 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Ssr4Q62186 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Ssr4Q62186 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ssr4Q62186 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ssr4Q62186 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ssr4Q62186 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ssr4Q62186 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ssr4Q62186 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ssr4Q62186 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Ssr4Q62186 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ssr4Q62186 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ssr4Q62186 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Ssr4Q62186 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Ssr4Q62186 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ssr4Q62186 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ssr4Q62186 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ssr4Q62186 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ssr4Q62186 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ssr4Q62186 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ssr4Q62186 Mir7023-201ENSMUST00000185093 64 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Ssr4Q62186 Prr29-205ENSMUST00000190268 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ssr4Q62186 Cdipt-205ENSMUST00000206450 951 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ssr4Q62186 Gm13410-201ENSMUST00000117058 1415 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Ssr4Q62186 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
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