Protein–RNA interactions for Protein: Q62181

Sema3c, Semaphorin-3C, mousemouse

Predictions only

Length 751 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sema3cQ62181 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sema3cQ62181 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sema3cQ62181 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sema3cQ62181 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sema3cQ62181 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sema3cQ62181 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sema3cQ62181 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sema3cQ62181 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sema3cQ62181 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Sema3cQ62181 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Sema3cQ62181 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Sema3cQ62181 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sema3cQ62181 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sema3cQ62181 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sema3cQ62181 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Sema3cQ62181 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sema3cQ62181 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sema3cQ62181 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sema3cQ62181 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Sema3cQ62181 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sema3cQ62181 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sema3cQ62181 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sema3cQ62181 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sema3cQ62181 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sema3cQ62181 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sema3cQ62181 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sema3cQ62181 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sema3cQ62181 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sema3cQ62181 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sema3cQ62181 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sema3cQ62181 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sema3cQ62181 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sema3cQ62181 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sema3cQ62181 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sema3cQ62181 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sema3cQ62181 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sema3cQ62181 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sema3cQ62181 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sema3cQ62181 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sema3cQ62181 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Sema3cQ62181 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sema3cQ62181 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sema3cQ62181 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Sema3cQ62181 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sema3cQ62181 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sema3cQ62181 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sema3cQ62181 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sema3cQ62181 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sema3cQ62181 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sema3cQ62181 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sema3cQ62181 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sema3cQ62181 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Sema3cQ62181 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sema3cQ62181 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sema3cQ62181 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Sema3cQ62181 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Sema3cQ62181 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Sema3cQ62181 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Sema3cQ62181 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Sema3cQ62181 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Sema3cQ62181 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Sema3cQ62181 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Sema3cQ62181 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Sema3cQ62181 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Sema3cQ62181 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Sema3cQ62181 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Sema3cQ62181 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Sema3cQ62181 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Sema3cQ62181 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Sema3cQ62181 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Sema3cQ62181 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Sema3cQ62181 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Sema3cQ62181 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Sema3cQ62181 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Sema3cQ62181 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Sema3cQ62181 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Sema3cQ62181 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Sema3cQ62181 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Sema3cQ62181 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Sema3cQ62181 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Sema3cQ62181 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Sema3cQ62181 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Sema3cQ62181 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Sema3cQ62181 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Sema3cQ62181 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Sema3cQ62181 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Sema3cQ62181 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Sema3cQ62181 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Sema3cQ62181 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Sema3cQ62181 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Sema3cQ62181 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Sema3cQ62181 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Sema3cQ62181 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Sema3cQ62181 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Sema3cQ62181 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Sema3cQ62181 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Sema3cQ62181 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Sema3cQ62181 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Sema3cQ62181 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Sema3cQ62181 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29 ms