Protein–RNA interactions for Protein: Q62178

Sema4a, Semaphorin-4A, mousemouse

Predictions only

Length 760 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sema4aQ62178 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sema4aQ62178 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sema4aQ62178 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sema4aQ62178 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sema4aQ62178 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sema4aQ62178 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sema4aQ62178 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sema4aQ62178 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sema4aQ62178 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Sema4aQ62178 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sema4aQ62178 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sema4aQ62178 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sema4aQ62178 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sema4aQ62178 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Sema4aQ62178 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sema4aQ62178 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Sema4aQ62178 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sema4aQ62178 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sema4aQ62178 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sema4aQ62178 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sema4aQ62178 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sema4aQ62178 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sema4aQ62178 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sema4aQ62178 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sema4aQ62178 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sema4aQ62178 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sema4aQ62178 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sema4aQ62178 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sema4aQ62178 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sema4aQ62178 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sema4aQ62178 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sema4aQ62178 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sema4aQ62178 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sema4aQ62178 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sema4aQ62178 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sema4aQ62178 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sema4aQ62178 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sema4aQ62178 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sema4aQ62178 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sema4aQ62178 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sema4aQ62178 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sema4aQ62178 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sema4aQ62178 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sema4aQ62178 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sema4aQ62178 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sema4aQ62178 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sema4aQ62178 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sema4aQ62178 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sema4aQ62178 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sema4aQ62178 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Sema4aQ62178 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Sema4aQ62178 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sema4aQ62178 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sema4aQ62178 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sema4aQ62178 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sema4aQ62178 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sema4aQ62178 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sema4aQ62178 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sema4aQ62178 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sema4aQ62178 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sema4aQ62178 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sema4aQ62178 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sema4aQ62178 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sema4aQ62178 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sema4aQ62178 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sema4aQ62178 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sema4aQ62178 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sema4aQ62178 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sema4aQ62178 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sema4aQ62178 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Sema4aQ62178 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sema4aQ62178 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sema4aQ62178 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Sema4aQ62178 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sema4aQ62178 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sema4aQ62178 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Sema4aQ62178 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Sema4aQ62178 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sema4aQ62178 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sema4aQ62178 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sema4aQ62178 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sema4aQ62178 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sema4aQ62178 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sema4aQ62178 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Sema4aQ62178 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sema4aQ62178 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sema4aQ62178 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sema4aQ62178 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sema4aQ62178 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sema4aQ62178 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sema4aQ62178 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sema4aQ62178 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sema4aQ62178 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Sema4aQ62178 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sema4aQ62178 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sema4aQ62178 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Sema4aQ62178 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sema4aQ62178 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sema4aQ62178 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Sema4aQ62178 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.5 ms