Protein–RNA interactions for Protein: Q62141

Sin3b, Paired amphipathic helix protein Sin3b, mousemouse

Predictions only

Length 1,098 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sin3bQ62141 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Sin3bQ62141 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Sin3bQ62141 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Sin3bQ62141 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Sin3bQ62141 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Sin3bQ62141 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Sin3bQ62141 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Sin3bQ62141 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Sin3bQ62141 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Sin3bQ62141 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Sin3bQ62141 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Sin3bQ62141 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Sin3bQ62141 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Sin3bQ62141 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Sin3bQ62141 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Sin3bQ62141 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Sin3bQ62141 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Sin3bQ62141 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Sin3bQ62141 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Sin3bQ62141 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Sin3bQ62141 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Sin3bQ62141 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Sin3bQ62141 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Sin3bQ62141 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Sin3bQ62141 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Sin3bQ62141 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Sin3bQ62141 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Sin3bQ62141 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Sin3bQ62141 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Sin3bQ62141 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Sin3bQ62141 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.29
Sin3bQ62141 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Sin3bQ62141 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Sin3bQ62141 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Sin3bQ62141 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Sin3bQ62141 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Sin3bQ62141 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Sin3bQ62141 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Sin3bQ62141 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Sin3bQ62141 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Sin3bQ62141 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Sin3bQ62141 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Sin3bQ62141 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Sin3bQ62141 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Sin3bQ62141 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Sin3bQ62141 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Sin3bQ62141 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Sin3bQ62141 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Sin3bQ62141 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Sin3bQ62141 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Sin3bQ62141 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Sin3bQ62141 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Sin3bQ62141 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Sin3bQ62141 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Sin3bQ62141 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Sin3bQ62141 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Sin3bQ62141 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Sin3bQ62141 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Sin3bQ62141 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Sin3bQ62141 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Sin3bQ62141 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Sin3bQ62141 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Sin3bQ62141 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Sin3bQ62141 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Sin3bQ62141 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Sin3bQ62141 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Sin3bQ62141 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Sin3bQ62141 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Sin3bQ62141 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Sin3bQ62141 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Sin3bQ62141 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Sin3bQ62141 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Sin3bQ62141 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Sin3bQ62141 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Sin3bQ62141 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Sin3bQ62141 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Sin3bQ62141 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Sin3bQ62141 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Sin3bQ62141 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Sin3bQ62141 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Sin3bQ62141 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Sin3bQ62141 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Sin3bQ62141 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Sin3bQ62141 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Sin3bQ62141 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Sin3bQ62141 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Sin3bQ62141 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Sin3bQ62141 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Sin3bQ62141 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Sin3bQ62141 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Sin3bQ62141 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Sin3bQ62141 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Sin3bQ62141 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Sin3bQ62141 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Sin3bQ62141 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Sin3bQ62141 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Sin3bQ62141 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Sin3bQ62141 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Sin3bQ62141 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Sin3bQ62141 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.6 ms