Protein–RNA interactions for Protein: Q62074

Prkci, Protein kinase C iota type, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 595 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrkciQ62074 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PrkciQ62074 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PrkciQ62074 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PrkciQ62074 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PrkciQ62074 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PrkciQ62074 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PrkciQ62074 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PrkciQ62074 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PrkciQ62074 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PrkciQ62074 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
PrkciQ62074 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PrkciQ62074 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PrkciQ62074 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PrkciQ62074 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PrkciQ62074 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PrkciQ62074 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PrkciQ62074 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PrkciQ62074 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
PrkciQ62074 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PrkciQ62074 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PrkciQ62074 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
PrkciQ62074 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
PrkciQ62074 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PrkciQ62074 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PrkciQ62074 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PrkciQ62074 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PrkciQ62074 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PrkciQ62074 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PrkciQ62074 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PrkciQ62074 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PrkciQ62074 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PrkciQ62074 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PrkciQ62074 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PrkciQ62074 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PrkciQ62074 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PrkciQ62074 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PrkciQ62074 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PrkciQ62074 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
PrkciQ62074 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PrkciQ62074 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PrkciQ62074 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
PrkciQ62074 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PrkciQ62074 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PrkciQ62074 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PrkciQ62074 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PrkciQ62074 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PrkciQ62074 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PrkciQ62074 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PrkciQ62074 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PrkciQ62074 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PrkciQ62074 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PrkciQ62074 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PrkciQ62074 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PrkciQ62074 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PrkciQ62074 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PrkciQ62074 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PrkciQ62074 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
PrkciQ62074 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
PrkciQ62074 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
PrkciQ62074 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
PrkciQ62074 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PrkciQ62074 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PrkciQ62074 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PrkciQ62074 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PrkciQ62074 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PrkciQ62074 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PrkciQ62074 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PrkciQ62074 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
PrkciQ62074 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PrkciQ62074 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PrkciQ62074 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PrkciQ62074 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
PrkciQ62074 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
PrkciQ62074 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PrkciQ62074 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PrkciQ62074 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PrkciQ62074 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PrkciQ62074 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PrkciQ62074 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PrkciQ62074 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PrkciQ62074 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PrkciQ62074 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PrkciQ62074 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PrkciQ62074 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PrkciQ62074 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PrkciQ62074 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PrkciQ62074 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PrkciQ62074 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PrkciQ62074 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PrkciQ62074 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PrkciQ62074 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PrkciQ62074 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PrkciQ62074 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PrkciQ62074 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PrkciQ62074 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
PrkciQ62074 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PrkciQ62074 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PrkciQ62074 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PrkciQ62074 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
PrkciQ62074 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.9 ms