Protein–RNA interactions for Protein: Q62059

Vcan, Versican core protein, mousemouse

Predictions only

Length 3,357 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VcanQ62059 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
VcanQ62059 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
VcanQ62059 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
VcanQ62059 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
VcanQ62059 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
VcanQ62059 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
VcanQ62059 Ntan1-202ENSMUST00000115805 984 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
VcanQ62059 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
VcanQ62059 Gm6266-201ENSMUST00000203844 806 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
VcanQ62059 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
VcanQ62059 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
VcanQ62059 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
VcanQ62059 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
VcanQ62059 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
VcanQ62059 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
VcanQ62059 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
VcanQ62059 9430007M09Rik-201ENSMUST00000201947 804 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
VcanQ62059 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
VcanQ62059 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
VcanQ62059 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
VcanQ62059 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
VcanQ62059 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
VcanQ62059 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
VcanQ62059 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
VcanQ62059 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
VcanQ62059 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
VcanQ62059 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
VcanQ62059 Cyp21a2-ps-201ENSMUST00000172970 1383 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
VcanQ62059 Metrnl-202ENSMUST00000106089 1101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
VcanQ62059 Gm11535-201ENSMUST00000145517 778 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
VcanQ62059 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
VcanQ62059 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
VcanQ62059 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
VcanQ62059 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
VcanQ62059 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
VcanQ62059 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
VcanQ62059 Tmem80-205ENSMUST00000132061 667 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
VcanQ62059 Slc12a5-208ENSMUST00000202479 1202 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
VcanQ62059 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
VcanQ62059 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
VcanQ62059 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
VcanQ62059 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
VcanQ62059 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
VcanQ62059 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
VcanQ62059 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
VcanQ62059 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
VcanQ62059 Mettl23-201ENSMUST00000106370 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
VcanQ62059 Mir1247-201ENSMUST00000116706 82 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
VcanQ62059 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
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VcanQ62059 Gm45331-201ENSMUST00000209868 554 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
VcanQ62059 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
VcanQ62059 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
VcanQ62059 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
VcanQ62059 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
VcanQ62059 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
VcanQ62059 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
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VcanQ62059 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
VcanQ62059 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
VcanQ62059 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
VcanQ62059 Atat1-203ENSMUST00000077494 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
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VcanQ62059 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
VcanQ62059 Cenpm-201ENSMUST00000089155 1109 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
VcanQ62059 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
VcanQ62059 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
VcanQ62059 Ldhal6b-201ENSMUST00000189788 1445 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
VcanQ62059 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
VcanQ62059 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
VcanQ62059 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
VcanQ62059 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
VcanQ62059 Rnd1-203ENSMUST00000120997 856 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
VcanQ62059 Gm23984-201ENSMUST00000157139 203 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
VcanQ62059 Gm20753-201ENSMUST00000190105 545 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
VcanQ62059 Klrg2-202ENSMUST00000201345 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
VcanQ62059 Serpina16-201ENSMUST00000095451 1257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
VcanQ62059 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
VcanQ62059 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
VcanQ62059 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
VcanQ62059 Dancr-202ENSMUST00000120364 575 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
VcanQ62059 Gm27680-201ENSMUST00000184192 160 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
VcanQ62059 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
VcanQ62059 Lenep-201ENSMUST00000057431 1806 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
VcanQ62059 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
VcanQ62059 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
VcanQ62059 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
VcanQ62059 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
VcanQ62059 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
VcanQ62059 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
VcanQ62059 Chchd7-207ENSMUST00000121210 548 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
VcanQ62059 Commd6-203ENSMUST00000168587 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
VcanQ62059 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
VcanQ62059 Gm45668-201ENSMUST00000211271 493 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
VcanQ62059 AC166341.4-201ENSMUST00000220625 123 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
VcanQ62059 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
VcanQ62059 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
VcanQ62059 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
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