Protein–RNA interactions for Protein: Q61878

Prg2, Bone marrow proteoglycan, mousemouse

Predictions only

Length 223 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prg2Q61878 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Prg2Q61878 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Prg2Q61878 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Prg2Q61878 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Prg2Q61878 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Prg2Q61878 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Prg2Q61878 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Prg2Q61878 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Prg2Q61878 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Prg2Q61878 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Prg2Q61878 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Prg2Q61878 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Prg2Q61878 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Prg2Q61878 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Prg2Q61878 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Prg2Q61878 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Prg2Q61878 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Prg2Q61878 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Prg2Q61878 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Prg2Q61878 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Prg2Q61878 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Prg2Q61878 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Prg2Q61878 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Prg2Q61878 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Prg2Q61878 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Prg2Q61878 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Prg2Q61878 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Prg2Q61878 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Prg2Q61878 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Prg2Q61878 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Prg2Q61878 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Prg2Q61878 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Prg2Q61878 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Prg2Q61878 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Prg2Q61878 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Prg2Q61878 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Prg2Q61878 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Prg2Q61878 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Prg2Q61878 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Prg2Q61878 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Prg2Q61878 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Prg2Q61878 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Prg2Q61878 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Prg2Q61878 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Prg2Q61878 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Prg2Q61878 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Prg2Q61878 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Prg2Q61878 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Prg2Q61878 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Prg2Q61878 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Prg2Q61878 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Prg2Q61878 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Prg2Q61878 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Prg2Q61878 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Prg2Q61878 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Prg2Q61878 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Prg2Q61878 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Prg2Q61878 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Prg2Q61878 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Prg2Q61878 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Prg2Q61878 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Prg2Q61878 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Prg2Q61878 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Prg2Q61878 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Prg2Q61878 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Prg2Q61878 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Prg2Q61878 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Prg2Q61878 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Prg2Q61878 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Prg2Q61878 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Prg2Q61878 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Prg2Q61878 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Prg2Q61878 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Prg2Q61878 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Prg2Q61878 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Prg2Q61878 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Prg2Q61878 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Prg2Q61878 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Prg2Q61878 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Prg2Q61878 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Prg2Q61878 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Prg2Q61878 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Prg2Q61878 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Prg2Q61878 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Prg2Q61878 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Prg2Q61878 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Prg2Q61878 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Prg2Q61878 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Prg2Q61878 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Prg2Q61878 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Prg2Q61878 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Prg2Q61878 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Prg2Q61878 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Prg2Q61878 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Prg2Q61878 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Prg2Q61878 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Prg2Q61878 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Prg2Q61878 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Prg2Q61878 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.07
Prg2Q61878 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.9 ms