Protein–RNA interactions for Protein: Q61635

Ifi47, GTP-binding protein, mousemouse

Predictions only

Length 420 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ifi47Q61635 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ifi47Q61635 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ifi47Q61635 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ifi47Q61635 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ifi47Q61635 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ifi47Q61635 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ifi47Q61635 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ifi47Q61635 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ifi47Q61635 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ifi47Q61635 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Ifi47Q61635 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Ifi47Q61635 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ifi47Q61635 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ifi47Q61635 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ifi47Q61635 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ifi47Q61635 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ifi47Q61635 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ifi47Q61635 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ifi47Q61635 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ifi47Q61635 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ifi47Q61635 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ifi47Q61635 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ifi47Q61635 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ifi47Q61635 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ifi47Q61635 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ifi47Q61635 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ifi47Q61635 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ifi47Q61635 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ifi47Q61635 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ifi47Q61635 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ifi47Q61635 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ifi47Q61635 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ifi47Q61635 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Ifi47Q61635 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ifi47Q61635 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ifi47Q61635 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ifi47Q61635 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ifi47Q61635 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ifi47Q61635 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ifi47Q61635 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ifi47Q61635 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ifi47Q61635 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ifi47Q61635 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ifi47Q61635 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ifi47Q61635 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ifi47Q61635 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ifi47Q61635 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ifi47Q61635 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ifi47Q61635 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ifi47Q61635 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ifi47Q61635 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ifi47Q61635 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ifi47Q61635 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ifi47Q61635 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ifi47Q61635 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ifi47Q61635 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ifi47Q61635 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ifi47Q61635 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ifi47Q61635 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Ifi47Q61635 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ifi47Q61635 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ifi47Q61635 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ifi47Q61635 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ifi47Q61635 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ifi47Q61635 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ifi47Q61635 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ifi47Q61635 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ifi47Q61635 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ifi47Q61635 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ifi47Q61635 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Ifi47Q61635 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ifi47Q61635 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ifi47Q61635 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ifi47Q61635 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ifi47Q61635 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ifi47Q61635 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ifi47Q61635 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ifi47Q61635 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ifi47Q61635 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ifi47Q61635 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Ifi47Q61635 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ifi47Q61635 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ifi47Q61635 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ifi47Q61635 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ifi47Q61635 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ifi47Q61635 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Ifi47Q61635 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ifi47Q61635 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ifi47Q61635 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Ifi47Q61635 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Ifi47Q61635 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ifi47Q61635 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ifi47Q61635 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ifi47Q61635 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ifi47Q61635 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ifi47Q61635 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ifi47Q61635 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ifi47Q61635 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ifi47Q61635 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ifi47Q61635 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.9 ms