Protein–RNA interactions for Protein: Q61474

Msi1, RNA-binding protein Musashi homolog 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 362 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Msi1Q61474 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Msi1Q61474 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Msi1Q61474 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Msi1Q61474 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Msi1Q61474 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Msi1Q61474 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Msi1Q61474 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Msi1Q61474 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Msi1Q61474 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Msi1Q61474 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Msi1Q61474 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Msi1Q61474 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Msi1Q61474 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Msi1Q61474 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Msi1Q61474 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Msi1Q61474 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Msi1Q61474 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Msi1Q61474 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Msi1Q61474 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Msi1Q61474 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Msi1Q61474 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Msi1Q61474 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Msi1Q61474 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Msi1Q61474 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Msi1Q61474 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Msi1Q61474 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Msi1Q61474 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Msi1Q61474 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Msi1Q61474 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Msi1Q61474 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Msi1Q61474 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Msi1Q61474 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Msi1Q61474 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Msi1Q61474 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Msi1Q61474 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Msi1Q61474 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Msi1Q61474 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Msi1Q61474 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Msi1Q61474 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Msi1Q61474 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Msi1Q61474 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Msi1Q61474 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Msi1Q61474 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Msi1Q61474 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Msi1Q61474 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Msi1Q61474 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Msi1Q61474 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Msi1Q61474 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Msi1Q61474 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Msi1Q61474 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Msi1Q61474 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Msi1Q61474 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Msi1Q61474 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Msi1Q61474 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Msi1Q61474 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Msi1Q61474 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Msi1Q61474 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Msi1Q61474 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Msi1Q61474 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Msi1Q61474 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Msi1Q61474 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Msi1Q61474 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Msi1Q61474 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Msi1Q61474 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Msi1Q61474 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Msi1Q61474 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Msi1Q61474 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Msi1Q61474 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Msi1Q61474 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Msi1Q61474 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Msi1Q61474 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Msi1Q61474 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Msi1Q61474 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Msi1Q61474 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Msi1Q61474 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Msi1Q61474 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Msi1Q61474 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Msi1Q61474 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Msi1Q61474 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Msi1Q61474 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Msi1Q61474 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Msi1Q61474 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Msi1Q61474 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Msi1Q61474 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Msi1Q61474 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Msi1Q61474 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Msi1Q61474 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Msi1Q61474 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Msi1Q61474 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Msi1Q61474 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Msi1Q61474 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Msi1Q61474 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Msi1Q61474 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Msi1Q61474 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Msi1Q61474 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Msi1Q61474 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Msi1Q61474 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Msi1Q61474 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Msi1Q61474 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Msi1Q61474 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.6 ms