Protein–RNA interactions for Protein: Q61418

Clcn4, H(+)/Cl(-) exchange transporter 4, mousemouse

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Length 747 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clcn4Q61418 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
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Clcn4Q61418 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Clcn4Q61418 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Clcn4Q61418 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
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Clcn4Q61418 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Clcn4Q61418 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Clcn4Q61418 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Clcn4Q61418 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Clcn4Q61418 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
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Clcn4Q61418 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
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Clcn4Q61418 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Clcn4Q61418 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Clcn4Q61418 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Clcn4Q61418 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Clcn4Q61418 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Clcn4Q61418 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
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Clcn4Q61418 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Clcn4Q61418 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Clcn4Q61418 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
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Clcn4Q61418 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
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Clcn4Q61418 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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Clcn4Q61418 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Clcn4Q61418 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Clcn4Q61418 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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Clcn4Q61418 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Clcn4Q61418 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Clcn4Q61418 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Clcn4Q61418 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Clcn4Q61418 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Clcn4Q61418 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Clcn4Q61418 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Clcn4Q61418 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Clcn4Q61418 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Clcn4Q61418 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Clcn4Q61418 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Clcn4Q61418 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Clcn4Q61418 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Clcn4Q61418 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Clcn4Q61418 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
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Clcn4Q61418 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Clcn4Q61418 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
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