Protein–RNA interactions for Protein: Q61398

Pcolce, Procollagen C-endopeptidase enhancer 1, mousemouse

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Length 468 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PcolceQ61398 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
PcolceQ61398 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
PcolceQ61398 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
PcolceQ61398 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
PcolceQ61398 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
PcolceQ61398 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
PcolceQ61398 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
PcolceQ61398 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
PcolceQ61398 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
PcolceQ61398 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
PcolceQ61398 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
PcolceQ61398 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
PcolceQ61398 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
PcolceQ61398 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
PcolceQ61398 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC13.68□□□□□ -0.22
PcolceQ61398 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
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PcolceQ61398 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC13.68□□□□□ -0.22
PcolceQ61398 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
PcolceQ61398 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
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PcolceQ61398 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
PcolceQ61398 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
PcolceQ61398 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
PcolceQ61398 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
PcolceQ61398 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
PcolceQ61398 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
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PcolceQ61398 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
PcolceQ61398 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
PcolceQ61398 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
PcolceQ61398 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
PcolceQ61398 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
PcolceQ61398 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
PcolceQ61398 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
PcolceQ61398 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
PcolceQ61398 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
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PcolceQ61398 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
PcolceQ61398 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
PcolceQ61398 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
PcolceQ61398 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
PcolceQ61398 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
PcolceQ61398 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
PcolceQ61398 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
PcolceQ61398 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
PcolceQ61398 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
PcolceQ61398 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
PcolceQ61398 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
PcolceQ61398 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
PcolceQ61398 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC13.67□□□□□ -0.22
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PcolceQ61398 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
PcolceQ61398 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
PcolceQ61398 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
PcolceQ61398 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
PcolceQ61398 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
PcolceQ61398 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
PcolceQ61398 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
PcolceQ61398 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
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PcolceQ61398 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
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PcolceQ61398 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
PcolceQ61398 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
PcolceQ61398 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
PcolceQ61398 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
PcolceQ61398 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
PcolceQ61398 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
PcolceQ61398 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
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PcolceQ61398 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
PcolceQ61398 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
PcolceQ61398 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
PcolceQ61398 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
PcolceQ61398 Gm7063-201ENSMUST00000186840 981 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
PcolceQ61398 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
PcolceQ61398 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
PcolceQ61398 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC13.66□□□□□ -0.22
PcolceQ61398 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC13.66□□□□□ -0.22
PcolceQ61398 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
PcolceQ61398 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
PcolceQ61398 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
PcolceQ61398 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
PcolceQ61398 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
PcolceQ61398 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
PcolceQ61398 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
PcolceQ61398 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
PcolceQ61398 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
PcolceQ61398 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
PcolceQ61398 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
PcolceQ61398 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
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