Protein–RNA interactions for Protein: Q61025

Ift20, Intraflagellar transport protein 20 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 132 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ift20Q61025 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ift20Q61025 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ift20Q61025 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ift20Q61025 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Ift20Q61025 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ift20Q61025 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ift20Q61025 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ift20Q61025 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ift20Q61025 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ift20Q61025 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ift20Q61025 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ift20Q61025 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ift20Q61025 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ift20Q61025 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ift20Q61025 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ift20Q61025 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ift20Q61025 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ift20Q61025 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ift20Q61025 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ift20Q61025 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ift20Q61025 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ift20Q61025 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ift20Q61025 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ift20Q61025 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ift20Q61025 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Ift20Q61025 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Ift20Q61025 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Ift20Q61025 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Ift20Q61025 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Ift20Q61025 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ift20Q61025 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ift20Q61025 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Ift20Q61025 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ift20Q61025 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ift20Q61025 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Ift20Q61025 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ift20Q61025 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Ift20Q61025 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ift20Q61025 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ift20Q61025 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ift20Q61025 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ift20Q61025 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ift20Q61025 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ift20Q61025 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ift20Q61025 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ift20Q61025 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ift20Q61025 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ift20Q61025 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ift20Q61025 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ift20Q61025 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ift20Q61025 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ift20Q61025 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ift20Q61025 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ift20Q61025 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ift20Q61025 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ift20Q61025 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ift20Q61025 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ift20Q61025 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ift20Q61025 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ift20Q61025 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ift20Q61025 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ift20Q61025 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ift20Q61025 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ift20Q61025 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ift20Q61025 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Ift20Q61025 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ift20Q61025 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ift20Q61025 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ift20Q61025 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ift20Q61025 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ift20Q61025 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ift20Q61025 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ift20Q61025 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ift20Q61025 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ift20Q61025 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ift20Q61025 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ift20Q61025 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ift20Q61025 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ift20Q61025 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ift20Q61025 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ift20Q61025 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ift20Q61025 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ift20Q61025 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ift20Q61025 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Ift20Q61025 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ift20Q61025 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ift20Q61025 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ift20Q61025 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ift20Q61025 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ift20Q61025 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ift20Q61025 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ift20Q61025 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ift20Q61025 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ift20Q61025 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ift20Q61025 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ift20Q61025 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ift20Q61025 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Ift20Q61025 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ift20Q61025 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ift20Q61025 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.6 ms