Protein–RNA interactions for Protein: Q60973

Rbbp7, Histone-binding protein RBBP7, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 425 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbbp7Q60973 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rbbp7Q60973 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rbbp7Q60973 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rbbp7Q60973 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rbbp7Q60973 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rbbp7Q60973 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rbbp7Q60973 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rbbp7Q60973 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rbbp7Q60973 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rbbp7Q60973 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rbbp7Q60973 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rbbp7Q60973 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rbbp7Q60973 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rbbp7Q60973 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Rbbp7Q60973 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rbbp7Q60973 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rbbp7Q60973 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rbbp7Q60973 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rbbp7Q60973 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rbbp7Q60973 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rbbp7Q60973 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rbbp7Q60973 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rbbp7Q60973 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rbbp7Q60973 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rbbp7Q60973 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rbbp7Q60973 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rbbp7Q60973 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rbbp7Q60973 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rbbp7Q60973 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rbbp7Q60973 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rbbp7Q60973 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rbbp7Q60973 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rbbp7Q60973 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rbbp7Q60973 Pcsk5-201ENSMUST00000025618 6675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rbbp7Q60973 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rbbp7Q60973 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rbbp7Q60973 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rbbp7Q60973 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Rbbp7Q60973 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rbbp7Q60973 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Rbbp7Q60973 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rbbp7Q60973 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rbbp7Q60973 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rbbp7Q60973 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rbbp7Q60973 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rbbp7Q60973 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rbbp7Q60973 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rbbp7Q60973 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rbbp7Q60973 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rbbp7Q60973 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rbbp7Q60973 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rbbp7Q60973 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rbbp7Q60973 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rbbp7Q60973 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rbbp7Q60973 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rbbp7Q60973 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rbbp7Q60973 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rbbp7Q60973 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Rbbp7Q60973 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rbbp7Q60973 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rbbp7Q60973 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rbbp7Q60973 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rbbp7Q60973 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rbbp7Q60973 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rbbp7Q60973 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rbbp7Q60973 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Rbbp7Q60973 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rbbp7Q60973 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rbbp7Q60973 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rbbp7Q60973 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rbbp7Q60973 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rbbp7Q60973 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rbbp7Q60973 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rbbp7Q60973 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rbbp7Q60973 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rbbp7Q60973 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rbbp7Q60973 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Rbbp7Q60973 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rbbp7Q60973 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rbbp7Q60973 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rbbp7Q60973 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rbbp7Q60973 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rbbp7Q60973 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rbbp7Q60973 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rbbp7Q60973 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rbbp7Q60973 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rbbp7Q60973 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rbbp7Q60973 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rbbp7Q60973 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rbbp7Q60973 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rbbp7Q60973 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rbbp7Q60973 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rbbp7Q60973 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rbbp7Q60973 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rbbp7Q60973 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rbbp7Q60973 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rbbp7Q60973 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rbbp7Q60973 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rbbp7Q60973 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rbbp7Q60973 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28 ms