Protein–RNA interactions for Protein: Q60925

Dbp, D site-binding protein, mousemouse

Predictions only

Length 325 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DbpQ60925 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
DbpQ60925 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
DbpQ60925 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
DbpQ60925 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
DbpQ60925 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
DbpQ60925 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
DbpQ60925 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
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DbpQ60925 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.2
DbpQ60925 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
DbpQ60925 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
DbpQ60925 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
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DbpQ60925 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
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DbpQ60925 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
DbpQ60925 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
DbpQ60925 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
DbpQ60925 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
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DbpQ60925 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC13.77□□□□□ -0.21
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DbpQ60925 Desi2-201ENSMUST00000027783 8802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
DbpQ60925 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
DbpQ60925 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
DbpQ60925 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
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DbpQ60925 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
DbpQ60925 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
DbpQ60925 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
DbpQ60925 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
DbpQ60925 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
DbpQ60925 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
DbpQ60925 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
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DbpQ60925 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
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DbpQ60925 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
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DbpQ60925 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
DbpQ60925 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
DbpQ60925 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
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DbpQ60925 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
DbpQ60925 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
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DbpQ60925 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
DbpQ60925 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
DbpQ60925 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
DbpQ60925 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
DbpQ60925 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
DbpQ60925 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
DbpQ60925 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
DbpQ60925 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
DbpQ60925 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
DbpQ60925 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
DbpQ60925 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
DbpQ60925 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
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DbpQ60925 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
DbpQ60925 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
DbpQ60925 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC13.75□□□□□ -0.21
DbpQ60925 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
DbpQ60925 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC13.75□□□□□ -0.21
DbpQ60925 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
DbpQ60925 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
DbpQ60925 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
DbpQ60925 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
DbpQ60925 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
DbpQ60925 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
DbpQ60925 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
DbpQ60925 Ppp1r3d-201ENSMUST00000058678 3267 ntAPPRIS P1 BASIC13.74□□□□□ -0.21
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