Protein–RNA interactions for Protein: Q60865

Caprin1, Caprin-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 707 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Caprin1Q60865 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Caprin1Q60865 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Caprin1Q60865 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Caprin1Q60865 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Caprin1Q60865 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Caprin1Q60865 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Caprin1Q60865 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Caprin1Q60865 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Caprin1Q60865 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Caprin1Q60865 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Caprin1Q60865 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Caprin1Q60865 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Caprin1Q60865 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Caprin1Q60865 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Caprin1Q60865 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Caprin1Q60865 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Caprin1Q60865 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Caprin1Q60865 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Caprin1Q60865 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Caprin1Q60865 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Caprin1Q60865 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Caprin1Q60865 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Caprin1Q60865 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Caprin1Q60865 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Caprin1Q60865 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Caprin1Q60865 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Caprin1Q60865 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Caprin1Q60865 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Caprin1Q60865 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Caprin1Q60865 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Caprin1Q60865 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Caprin1Q60865 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Caprin1Q60865 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Caprin1Q60865 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Caprin1Q60865 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Caprin1Q60865 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Caprin1Q60865 Foxp2-207ENSMUST00000115477 6760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Caprin1Q60865 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Caprin1Q60865 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Caprin1Q60865 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Caprin1Q60865 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Caprin1Q60865 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Caprin1Q60865 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Caprin1Q60865 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Caprin1Q60865 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Caprin1Q60865 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Caprin1Q60865 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Caprin1Q60865 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Caprin1Q60865 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Caprin1Q60865 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Caprin1Q60865 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Caprin1Q60865 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Caprin1Q60865 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Caprin1Q60865 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Caprin1Q60865 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
Caprin1Q60865 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Caprin1Q60865 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Caprin1Q60865 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Caprin1Q60865 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Caprin1Q60865 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Caprin1Q60865 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Caprin1Q60865 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Caprin1Q60865 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Caprin1Q60865 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Caprin1Q60865 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Caprin1Q60865 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Caprin1Q60865 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Caprin1Q60865 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Caprin1Q60865 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Caprin1Q60865 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Caprin1Q60865 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Caprin1Q60865 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Caprin1Q60865 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Caprin1Q60865 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Caprin1Q60865 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Caprin1Q60865 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Caprin1Q60865 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Caprin1Q60865 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Caprin1Q60865 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Caprin1Q60865 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Caprin1Q60865 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Caprin1Q60865 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Caprin1Q60865 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Caprin1Q60865 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Caprin1Q60865 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Caprin1Q60865 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Caprin1Q60865 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Caprin1Q60865 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Caprin1Q60865 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Caprin1Q60865 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Caprin1Q60865 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Caprin1Q60865 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Caprin1Q60865 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Caprin1Q60865 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Caprin1Q60865 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Caprin1Q60865 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Caprin1Q60865 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Caprin1Q60865 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Caprin1Q60865 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Caprin1Q60865 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.9 ms