Protein–RNA interactions for Protein: Q60846

Tnfrsf8, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 8, mousemouse

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Length 498 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfrsf8Q60846 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Tnfrsf8Q60846 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Tnfrsf8Q60846 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Tnfrsf8Q60846 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Tnfrsf8Q60846 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Tnfrsf8Q60846 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Tnfrsf8Q60846 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Tnfrsf8Q60846 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Tnfrsf8Q60846 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Tnfrsf8Q60846 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Tnfrsf8Q60846 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Tnfrsf8Q60846 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Tnfrsf8Q60846 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Tnfrsf8Q60846 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Tnfrsf8Q60846 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Tnfrsf8Q60846 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Tnfrsf8Q60846 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Tnfrsf8Q60846 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Tnfrsf8Q60846 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Tnfrsf8Q60846 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Tnfrsf8Q60846 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Tnfrsf8Q60846 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Tnfrsf8Q60846 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Tnfrsf8Q60846 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Tnfrsf8Q60846 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Tnfrsf8Q60846 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Tnfrsf8Q60846 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Tnfrsf8Q60846 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Tnfrsf8Q60846 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Tnfrsf8Q60846 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Tnfrsf8Q60846 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Tnfrsf8Q60846 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Tnfrsf8Q60846 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Tnfrsf8Q60846 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Tnfrsf8Q60846 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Tnfrsf8Q60846 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Tnfrsf8Q60846 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Tnfrsf8Q60846 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Tnfrsf8Q60846 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Tnfrsf8Q60846 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Tnfrsf8Q60846 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Tnfrsf8Q60846 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Tnfrsf8Q60846 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Tnfrsf8Q60846 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Tnfrsf8Q60846 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Tnfrsf8Q60846 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Tnfrsf8Q60846 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Tnfrsf8Q60846 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Tnfrsf8Q60846 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Tnfrsf8Q60846 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Tnfrsf8Q60846 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Tnfrsf8Q60846 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Tnfrsf8Q60846 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Tnfrsf8Q60846 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Tnfrsf8Q60846 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Tnfrsf8Q60846 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Tnfrsf8Q60846 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Tnfrsf8Q60846 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Tnfrsf8Q60846 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Tnfrsf8Q60846 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
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Tnfrsf8Q60846 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
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Tnfrsf8Q60846 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Tnfrsf8Q60846 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Tnfrsf8Q60846 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Tnfrsf8Q60846 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
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Tnfrsf8Q60846 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Tnfrsf8Q60846 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Tnfrsf8Q60846 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Tnfrsf8Q60846 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Tnfrsf8Q60846 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
Tnfrsf8Q60846 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Tnfrsf8Q60846 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Tnfrsf8Q60846 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Tnfrsf8Q60846 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Tnfrsf8Q60846 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Tnfrsf8Q60846 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Tnfrsf8Q60846 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Tnfrsf8Q60846 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Tnfrsf8Q60846 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Tnfrsf8Q60846 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Tnfrsf8Q60846 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Tnfrsf8Q60846 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Tnfrsf8Q60846 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Tnfrsf8Q60846 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Tnfrsf8Q60846 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Tnfrsf8Q60846 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Tnfrsf8Q60846 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Tnfrsf8Q60846 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Tnfrsf8Q60846 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Tnfrsf8Q60846 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Tnfrsf8Q60846 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Tnfrsf8Q60846 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Tnfrsf8Q60846 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Tnfrsf8Q60846 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Tnfrsf8Q60846 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
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