Protein–RNA interactions for Protein: Q60772

Cdkn2c, Cyclin-dependent kinase 4 inhibitor C, mousemouse

Predictions only

Length 168 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdkn2cQ60772 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cdkn2cQ60772 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cdkn2cQ60772 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cdkn2cQ60772 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cdkn2cQ60772 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cdkn2cQ60772 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cdkn2cQ60772 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cdkn2cQ60772 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cdkn2cQ60772 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cdkn2cQ60772 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cdkn2cQ60772 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cdkn2cQ60772 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cdkn2cQ60772 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cdkn2cQ60772 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cdkn2cQ60772 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cdkn2cQ60772 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cdkn2cQ60772 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cdkn2cQ60772 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cdkn2cQ60772 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cdkn2cQ60772 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cdkn2cQ60772 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cdkn2cQ60772 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cdkn2cQ60772 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cdkn2cQ60772 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Cdkn2cQ60772 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cdkn2cQ60772 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cdkn2cQ60772 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cdkn2cQ60772 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cdkn2cQ60772 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cdkn2cQ60772 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cdkn2cQ60772 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cdkn2cQ60772 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cdkn2cQ60772 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cdkn2cQ60772 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Cdkn2cQ60772 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cdkn2cQ60772 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cdkn2cQ60772 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Cdkn2cQ60772 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cdkn2cQ60772 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cdkn2cQ60772 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cdkn2cQ60772 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cdkn2cQ60772 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cdkn2cQ60772 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Cdkn2cQ60772 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cdkn2cQ60772 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cdkn2cQ60772 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Cdkn2cQ60772 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cdkn2cQ60772 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cdkn2cQ60772 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cdkn2cQ60772 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cdkn2cQ60772 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cdkn2cQ60772 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cdkn2cQ60772 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cdkn2cQ60772 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cdkn2cQ60772 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cdkn2cQ60772 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cdkn2cQ60772 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cdkn2cQ60772 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cdkn2cQ60772 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cdkn2cQ60772 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cdkn2cQ60772 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cdkn2cQ60772 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cdkn2cQ60772 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cdkn2cQ60772 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cdkn2cQ60772 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cdkn2cQ60772 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cdkn2cQ60772 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cdkn2cQ60772 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cdkn2cQ60772 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cdkn2cQ60772 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cdkn2cQ60772 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cdkn2cQ60772 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cdkn2cQ60772 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cdkn2cQ60772 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cdkn2cQ60772 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cdkn2cQ60772 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cdkn2cQ60772 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cdkn2cQ60772 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cdkn2cQ60772 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cdkn2cQ60772 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cdkn2cQ60772 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cdkn2cQ60772 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cdkn2cQ60772 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cdkn2cQ60772 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cdkn2cQ60772 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cdkn2cQ60772 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cdkn2cQ60772 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cdkn2cQ60772 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Cdkn2cQ60772 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Cdkn2cQ60772 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cdkn2cQ60772 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cdkn2cQ60772 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cdkn2cQ60772 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cdkn2cQ60772 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cdkn2cQ60772 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cdkn2cQ60772 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cdkn2cQ60772 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cdkn2cQ60772 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cdkn2cQ60772 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cdkn2cQ60772 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.2 ms