Protein–RNA interactions for Protein: Q60766

Irgm1, Immunity-related GTPase family M protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 409 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irgm1Q60766 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Irgm1Q60766 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Irgm1Q60766 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Irgm1Q60766 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Irgm1Q60766 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Irgm1Q60766 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Irgm1Q60766 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Irgm1Q60766 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Irgm1Q60766 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Irgm1Q60766 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Irgm1Q60766 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Irgm1Q60766 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Irgm1Q60766 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Irgm1Q60766 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Irgm1Q60766 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Irgm1Q60766 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Irgm1Q60766 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Irgm1Q60766 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Irgm1Q60766 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Irgm1Q60766 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Irgm1Q60766 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Irgm1Q60766 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Irgm1Q60766 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Irgm1Q60766 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Irgm1Q60766 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Irgm1Q60766 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Irgm1Q60766 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Irgm1Q60766 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Irgm1Q60766 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Irgm1Q60766 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Irgm1Q60766 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Irgm1Q60766 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Irgm1Q60766 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Irgm1Q60766 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Irgm1Q60766 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Irgm1Q60766 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Irgm1Q60766 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
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Irgm1Q60766 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
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Irgm1Q60766 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
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Irgm1Q60766 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
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Irgm1Q60766 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Irgm1Q60766 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Irgm1Q60766 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Irgm1Q60766 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Irgm1Q60766 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
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Irgm1Q60766 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Irgm1Q60766 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Irgm1Q60766 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Irgm1Q60766 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Irgm1Q60766 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Irgm1Q60766 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
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Irgm1Q60766 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Irgm1Q60766 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Irgm1Q60766 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Irgm1Q60766 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Irgm1Q60766 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Irgm1Q60766 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Irgm1Q60766 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Irgm1Q60766 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Irgm1Q60766 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Irgm1Q60766 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Irgm1Q60766 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Irgm1Q60766 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Irgm1Q60766 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
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Irgm1Q60766 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
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Irgm1Q60766 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
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