Protein–RNA interactions for Protein: Q60764

Mkrn3, Probable E3 ubiquitin-protein ligase makorin-3, mousemouse

Predictions only

Length 544 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mkrn3Q60764 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Mkrn3Q60764 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Mkrn3Q60764 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Mkrn3Q60764 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Mkrn3Q60764 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Mkrn3Q60764 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Mkrn3Q60764 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Mkrn3Q60764 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Mkrn3Q60764 Gm37660-201ENSMUST00000192754 1732 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Mkrn3Q60764 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Mkrn3Q60764 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Mkrn3Q60764 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Mkrn3Q60764 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Mkrn3Q60764 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Mkrn3Q60764 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Mkrn3Q60764 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Mkrn3Q60764 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Mkrn3Q60764 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Mkrn3Q60764 4933435F18Rik-202ENSMUST00000154878 2174 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Mkrn3Q60764 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Mkrn3Q60764 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Mkrn3Q60764 Gm11755-201ENSMUST00000144096 891 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Mkrn3Q60764 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Mkrn3Q60764 Gm20865-201ENSMUST00000179095 856 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Mkrn3Q60764 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Mkrn3Q60764 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Mkrn3Q60764 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Mkrn3Q60764 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Mkrn3Q60764 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Mkrn3Q60764 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Mkrn3Q60764 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Mkrn3Q60764 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Mkrn3Q60764 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Mkrn3Q60764 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Mkrn3Q60764 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Mkrn3Q60764 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Mkrn3Q60764 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Mkrn3Q60764 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Mkrn3Q60764 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Mkrn3Q60764 Stk33-202ENSMUST00000106745 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Mkrn3Q60764 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Mkrn3Q60764 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Mkrn3Q60764 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Mkrn3Q60764 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Mkrn3Q60764 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Mkrn3Q60764 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Mkrn3Q60764 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Mkrn3Q60764 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Mkrn3Q60764 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Mkrn3Q60764 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Mkrn3Q60764 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Mkrn3Q60764 Pgm2-201ENSMUST00000058351 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Mkrn3Q60764 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Mkrn3Q60764 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Mkrn3Q60764 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Mkrn3Q60764 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Mkrn3Q60764 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Mkrn3Q60764 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Mkrn3Q60764 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Mkrn3Q60764 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Mkrn3Q60764 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Mkrn3Q60764 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Mkrn3Q60764 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Mkrn3Q60764 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Mkrn3Q60764 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Mkrn3Q60764 Defa-ps4-201ENSMUST00000118021 183 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Mkrn3Q60764 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Mkrn3Q60764 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Mkrn3Q60764 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Mkrn3Q60764 4930412E21Rik-201ENSMUST00000194267 778 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Mkrn3Q60764 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Mkrn3Q60764 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Mkrn3Q60764 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Mkrn3Q60764 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Mkrn3Q60764 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Mkrn3Q60764 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Mkrn3Q60764 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Mkrn3Q60764 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Mkrn3Q60764 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Mkrn3Q60764 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Mkrn3Q60764 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Mkrn3Q60764 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Mkrn3Q60764 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Mkrn3Q60764 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Mkrn3Q60764 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Mkrn3Q60764 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Mkrn3Q60764 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Mkrn3Q60764 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Mkrn3Q60764 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Mkrn3Q60764 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Mkrn3Q60764 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Mkrn3Q60764 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Mkrn3Q60764 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Mkrn3Q60764 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Mkrn3Q60764 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Mkrn3Q60764 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Mkrn3Q60764 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Mkrn3Q60764 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Mkrn3Q60764 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Mkrn3Q60764 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.7 ms