Protein–RNA interactions for Protein: Q60710

Samhd1, Deoxynucleoside triphosphate triphosphohydrolase SAMHD1, mousemouse

Predictions only

Length 627 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samhd1Q60710 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Samhd1Q60710 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Samhd1Q60710 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Samhd1Q60710 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Samhd1Q60710 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Samhd1Q60710 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Samhd1Q60710 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Samhd1Q60710 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Samhd1Q60710 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Samhd1Q60710 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Samhd1Q60710 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Samhd1Q60710 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Samhd1Q60710 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Samhd1Q60710 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Samhd1Q60710 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Samhd1Q60710 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Samhd1Q60710 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Samhd1Q60710 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Samhd1Q60710 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Samhd1Q60710 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Samhd1Q60710 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Samhd1Q60710 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Samhd1Q60710 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Samhd1Q60710 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Samhd1Q60710 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Samhd1Q60710 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Samhd1Q60710 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Samhd1Q60710 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Samhd1Q60710 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Samhd1Q60710 Sumo3-204ENSMUST00000129492 487 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Samhd1Q60710 Gm15706-201ENSMUST00000139612 899 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Samhd1Q60710 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Samhd1Q60710 Gm44662-201ENSMUST00000206970 412 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Samhd1Q60710 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Samhd1Q60710 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Samhd1Q60710 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Samhd1Q60710 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Samhd1Q60710 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Samhd1Q60710 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Samhd1Q60710 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Samhd1Q60710 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Samhd1Q60710 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Samhd1Q60710 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Samhd1Q60710 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Samhd1Q60710 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Samhd1Q60710 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Samhd1Q60710 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Samhd1Q60710 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Samhd1Q60710 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Samhd1Q60710 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Samhd1Q60710 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Samhd1Q60710 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Samhd1Q60710 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Samhd1Q60710 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Samhd1Q60710 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Samhd1Q60710 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Samhd1Q60710 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Samhd1Q60710 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Samhd1Q60710 Gm10576-201ENSMUST00000191927 825 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Samhd1Q60710 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Samhd1Q60710 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Samhd1Q60710 Chchd1-203ENSMUST00000224633 557 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Samhd1Q60710 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Samhd1Q60710 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Samhd1Q60710 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Samhd1Q60710 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Samhd1Q60710 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Samhd1Q60710 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Samhd1Q60710 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Samhd1Q60710 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Samhd1Q60710 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Samhd1Q60710 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Samhd1Q60710 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Samhd1Q60710 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Samhd1Q60710 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Samhd1Q60710 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Samhd1Q60710 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Samhd1Q60710 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Samhd1Q60710 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Samhd1Q60710 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Samhd1Q60710 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Samhd1Q60710 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Samhd1Q60710 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Samhd1Q60710 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Samhd1Q60710 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Samhd1Q60710 Ms4a6d-202ENSMUST00000125291 679 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Samhd1Q60710 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Samhd1Q60710 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Samhd1Q60710 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Samhd1Q60710 Gm20646-202ENSMUST00000199521 660 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Samhd1Q60710 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Samhd1Q60710 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Samhd1Q60710 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Samhd1Q60710 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Samhd1Q60710 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Samhd1Q60710 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Samhd1Q60710 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Samhd1Q60710 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Samhd1Q60710 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Samhd1Q60710 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.5 ms