Protein–RNA interactions for Protein: Q60649

Clpb, Caseinolytic peptidase B protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 677 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ClpbQ60649 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ClpbQ60649 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ClpbQ60649 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ClpbQ60649 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ClpbQ60649 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ClpbQ60649 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ClpbQ60649 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ClpbQ60649 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ClpbQ60649 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ClpbQ60649 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ClpbQ60649 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ClpbQ60649 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
ClpbQ60649 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ClpbQ60649 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ClpbQ60649 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ClpbQ60649 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ClpbQ60649 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ClpbQ60649 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ClpbQ60649 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ClpbQ60649 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ClpbQ60649 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ClpbQ60649 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ClpbQ60649 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ClpbQ60649 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ClpbQ60649 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
ClpbQ60649 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ClpbQ60649 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ClpbQ60649 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ClpbQ60649 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ClpbQ60649 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ClpbQ60649 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ClpbQ60649 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ClpbQ60649 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ClpbQ60649 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ClpbQ60649 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ClpbQ60649 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ClpbQ60649 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ClpbQ60649 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ClpbQ60649 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ClpbQ60649 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ClpbQ60649 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ClpbQ60649 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ClpbQ60649 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ClpbQ60649 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ClpbQ60649 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ClpbQ60649 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ClpbQ60649 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ClpbQ60649 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ClpbQ60649 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ClpbQ60649 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ClpbQ60649 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ClpbQ60649 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ClpbQ60649 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ClpbQ60649 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ClpbQ60649 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
ClpbQ60649 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ClpbQ60649 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ClpbQ60649 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ClpbQ60649 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ClpbQ60649 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ClpbQ60649 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ClpbQ60649 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ClpbQ60649 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ClpbQ60649 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ClpbQ60649 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ClpbQ60649 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ClpbQ60649 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ClpbQ60649 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ClpbQ60649 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ClpbQ60649 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ClpbQ60649 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ClpbQ60649 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ClpbQ60649 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ClpbQ60649 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ClpbQ60649 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ClpbQ60649 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ClpbQ60649 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ClpbQ60649 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ClpbQ60649 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ClpbQ60649 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ClpbQ60649 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ClpbQ60649 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
ClpbQ60649 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
ClpbQ60649 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ClpbQ60649 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ClpbQ60649 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
ClpbQ60649 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ClpbQ60649 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ClpbQ60649 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ClpbQ60649 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ClpbQ60649 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ClpbQ60649 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ClpbQ60649 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ClpbQ60649 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ClpbQ60649 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ClpbQ60649 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ClpbQ60649 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ClpbQ60649 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ClpbQ60649 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ClpbQ60649 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32 ms