Protein–RNA interactions for Protein: Q60636

Prdm1, PR domain zinc finger protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 856 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prdm1Q60636 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Prdm1Q60636 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Prdm1Q60636 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Prdm1Q60636 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Prdm1Q60636 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Prdm1Q60636 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Prdm1Q60636 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Prdm1Q60636 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Prdm1Q60636 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Prdm1Q60636 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Prdm1Q60636 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Prdm1Q60636 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Prdm1Q60636 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Prdm1Q60636 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Prdm1Q60636 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Prdm1Q60636 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Prdm1Q60636 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Prdm1Q60636 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Prdm1Q60636 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Prdm1Q60636 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Prdm1Q60636 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Prdm1Q60636 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Prdm1Q60636 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Prdm1Q60636 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Prdm1Q60636 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Prdm1Q60636 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Prdm1Q60636 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Prdm1Q60636 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Prdm1Q60636 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Prdm1Q60636 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Prdm1Q60636 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Prdm1Q60636 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Prdm1Q60636 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Prdm1Q60636 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Prdm1Q60636 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Prdm1Q60636 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Prdm1Q60636 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Prdm1Q60636 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Prdm1Q60636 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Prdm1Q60636 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Prdm1Q60636 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Prdm1Q60636 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Prdm1Q60636 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Prdm1Q60636 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Prdm1Q60636 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Prdm1Q60636 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Prdm1Q60636 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Prdm1Q60636 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Prdm1Q60636 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Prdm1Q60636 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Prdm1Q60636 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Prdm1Q60636 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Prdm1Q60636 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Prdm1Q60636 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Prdm1Q60636 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Prdm1Q60636 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Prdm1Q60636 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Prdm1Q60636 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Prdm1Q60636 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Prdm1Q60636 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Prdm1Q60636 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Prdm1Q60636 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Prdm1Q60636 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.54
Prdm1Q60636 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Prdm1Q60636 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Prdm1Q60636 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Prdm1Q60636 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Prdm1Q60636 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Prdm1Q60636 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Prdm1Q60636 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Prdm1Q60636 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Prdm1Q60636 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Prdm1Q60636 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Prdm1Q60636 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Prdm1Q60636 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Prdm1Q60636 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Prdm1Q60636 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Prdm1Q60636 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Prdm1Q60636 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Prdm1Q60636 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Prdm1Q60636 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Prdm1Q60636 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Prdm1Q60636 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Prdm1Q60636 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Prdm1Q60636 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Prdm1Q60636 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Prdm1Q60636 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Prdm1Q60636 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Prdm1Q60636 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Prdm1Q60636 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Prdm1Q60636 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Prdm1Q60636 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Prdm1Q60636 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Prdm1Q60636 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Prdm1Q60636 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Prdm1Q60636 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Prdm1Q60636 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Prdm1Q60636 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Prdm1Q60636 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Prdm1Q60636 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.6 ms