Protein–RNA interactions for Protein: Q5SVD5

Vmn1r196, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

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Length 301 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r196Q5SVD5 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Vmn1r196Q5SVD5 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Vmn1r196Q5SVD5 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Vmn1r196Q5SVD5 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Vmn1r196Q5SVD5 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Vmn1r196Q5SVD5 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Vmn1r196Q5SVD5 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Vmn1r196Q5SVD5 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Vmn1r196Q5SVD5 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Vmn1r196Q5SVD5 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Vmn1r196Q5SVD5 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Vmn1r196Q5SVD5 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Vmn1r196Q5SVD5 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Vmn1r196Q5SVD5 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Vmn1r196Q5SVD5 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Vmn1r196Q5SVD5 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Vmn1r196Q5SVD5 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Vmn1r196Q5SVD5 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Vmn1r196Q5SVD5 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Vmn1r196Q5SVD5 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Vmn1r196Q5SVD5 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Vmn1r196Q5SVD5 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Vmn1r196Q5SVD5 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Vmn1r196Q5SVD5 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Vmn1r196Q5SVD5 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Vmn1r196Q5SVD5 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Vmn1r196Q5SVD5 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Vmn1r196Q5SVD5 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Vmn1r196Q5SVD5 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Vmn1r196Q5SVD5 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Vmn1r196Q5SVD5 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Vmn1r196Q5SVD5 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Vmn1r196Q5SVD5 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
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Vmn1r196Q5SVD5 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Vmn1r196Q5SVD5 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
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Vmn1r196Q5SVD5 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
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Vmn1r196Q5SVD5 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
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Vmn1r196Q5SVD5 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
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Vmn1r196Q5SVD5 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Vmn1r196Q5SVD5 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
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Vmn1r196Q5SVD5 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Vmn1r196Q5SVD5 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Vmn1r196Q5SVD5 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Vmn1r196Q5SVD5 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Vmn1r196Q5SVD5 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
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Vmn1r196Q5SVD5 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC14.46□□□□□ -0.09
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Vmn1r196Q5SVD5 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Vmn1r196Q5SVD5 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
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Vmn1r196Q5SVD5 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Vmn1r196Q5SVD5 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Vmn1r196Q5SVD5 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
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Vmn1r196Q5SVD5 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Vmn1r196Q5SVD5 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Vmn1r196Q5SVD5 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Vmn1r196Q5SVD5 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Vmn1r196Q5SVD5 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Vmn1r196Q5SVD5 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Vmn1r196Q5SVD5 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Vmn1r196Q5SVD5 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Vmn1r196Q5SVD5 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Vmn1r196Q5SVD5 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.1
Vmn1r196Q5SVD5 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Vmn1r196Q5SVD5 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC14.46□□□□□ -0.1
Vmn1r196Q5SVD5 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Vmn1r196Q5SVD5 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Vmn1r196Q5SVD5 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Vmn1r196Q5SVD5 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Vmn1r196Q5SVD5 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC14.45□□□□□ -0.1
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