Protein–RNA interactions for Protein: Q5SV85

Synrg, Synergin gamma, mousemouse

Predictions only

Length 1,306 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SynrgQ5SV85 Tspan31-201ENSMUST00000060991 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SynrgQ5SV85 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SynrgQ5SV85 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SynrgQ5SV85 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SynrgQ5SV85 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SynrgQ5SV85 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SynrgQ5SV85 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SynrgQ5SV85 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SynrgQ5SV85 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SynrgQ5SV85 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SynrgQ5SV85 Styxl1-204ENSMUST00000111163 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SynrgQ5SV85 Adprm-201ENSMUST00000116363 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SynrgQ5SV85 Arpp19-210ENSMUST00000170308 429 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SynrgQ5SV85 Mir6956-201ENSMUST00000183598 62 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
SynrgQ5SV85 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SynrgQ5SV85 H2-Bl-209ENSMUST00000194244 862 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SynrgQ5SV85 Nckipsd-206ENSMUST00000195323 467 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SynrgQ5SV85 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SynrgQ5SV85 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
SynrgQ5SV85 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SynrgQ5SV85 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SynrgQ5SV85 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SynrgQ5SV85 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SynrgQ5SV85 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SynrgQ5SV85 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SynrgQ5SV85 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SynrgQ5SV85 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SynrgQ5SV85 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SynrgQ5SV85 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SynrgQ5SV85 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SynrgQ5SV85 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SynrgQ5SV85 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SynrgQ5SV85 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SynrgQ5SV85 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SynrgQ5SV85 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SynrgQ5SV85 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SynrgQ5SV85 Nup188-205ENSMUST00000138666 534 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SynrgQ5SV85 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SynrgQ5SV85 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
SynrgQ5SV85 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SynrgQ5SV85 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
SynrgQ5SV85 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
SynrgQ5SV85 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
SynrgQ5SV85 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SynrgQ5SV85 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SynrgQ5SV85 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SynrgQ5SV85 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SynrgQ5SV85 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SynrgQ5SV85 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SynrgQ5SV85 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SynrgQ5SV85 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SynrgQ5SV85 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SynrgQ5SV85 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SynrgQ5SV85 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SynrgQ5SV85 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SynrgQ5SV85 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SynrgQ5SV85 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SynrgQ5SV85 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SynrgQ5SV85 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
SynrgQ5SV85 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SynrgQ5SV85 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SynrgQ5SV85 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SynrgQ5SV85 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SynrgQ5SV85 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SynrgQ5SV85 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SynrgQ5SV85 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SynrgQ5SV85 Gm17455-201ENSMUST00000164428 855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SynrgQ5SV85 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SynrgQ5SV85 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SynrgQ5SV85 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SynrgQ5SV85 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SynrgQ5SV85 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SynrgQ5SV85 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SynrgQ5SV85 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SynrgQ5SV85 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SynrgQ5SV85 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SynrgQ5SV85 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SynrgQ5SV85 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SynrgQ5SV85 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SynrgQ5SV85 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SynrgQ5SV85 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SynrgQ5SV85 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
SynrgQ5SV85 Timm13-201ENSMUST00000020440 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SynrgQ5SV85 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SynrgQ5SV85 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
SynrgQ5SV85 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SynrgQ5SV85 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SynrgQ5SV85 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SynrgQ5SV85 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SynrgQ5SV85 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SynrgQ5SV85 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SynrgQ5SV85 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SynrgQ5SV85 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SynrgQ5SV85 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SynrgQ5SV85 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
SynrgQ5SV85 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
SynrgQ5SV85 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
SynrgQ5SV85 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC18.02■□□□□ 0.47
SynrgQ5SV85 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
SynrgQ5SV85 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.8 ms