Protein–RNA interactions for Protein: Q5STT6

Fam71b, Protein FAM71B, mousemouse

Predictions only

Length 665 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam71bQ5STT6 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Fam71bQ5STT6 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Fam71bQ5STT6 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Fam71bQ5STT6 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Fam71bQ5STT6 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Fam71bQ5STT6 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Fam71bQ5STT6 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Fam71bQ5STT6 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Fam71bQ5STT6 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Fam71bQ5STT6 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Fam71bQ5STT6 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Fam71bQ5STT6 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Fam71bQ5STT6 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Fam71bQ5STT6 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Fam71bQ5STT6 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Fam71bQ5STT6 Srp68-202ENSMUST00000106425 2330 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Fam71bQ5STT6 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Fam71bQ5STT6 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Fam71bQ5STT6 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Fam71bQ5STT6 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Fam71bQ5STT6 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Fam71bQ5STT6 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Fam71bQ5STT6 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Fam71bQ5STT6 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Fam71bQ5STT6 2610011E03Rik-201ENSMUST00000200128 2235 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Fam71bQ5STT6 Map3k9-202ENSMUST00000222322 3303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Fam71bQ5STT6 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Fam71bQ5STT6 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Fam71bQ5STT6 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Fam71bQ5STT6 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Fam71bQ5STT6 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Fam71bQ5STT6 Mpzl2-201ENSMUST00000034600 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Fam71bQ5STT6 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Fam71bQ5STT6 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Fam71bQ5STT6 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Fam71bQ5STT6 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Fam71bQ5STT6 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Fam71bQ5STT6 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Fam71bQ5STT6 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Fam71bQ5STT6 Slc27a1-201ENSMUST00000034267 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Fam71bQ5STT6 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Fam71bQ5STT6 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Fam71bQ5STT6 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Fam71bQ5STT6 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Fam71bQ5STT6 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Fam71bQ5STT6 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Fam71bQ5STT6 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Fam71bQ5STT6 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Fam71bQ5STT6 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Fam71bQ5STT6 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Fam71bQ5STT6 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Fam71bQ5STT6 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Fam71bQ5STT6 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Fam71bQ5STT6 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Fam71bQ5STT6 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Fam71bQ5STT6 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Fam71bQ5STT6 Kif9-204ENSMUST00000198043 2233 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Fam71bQ5STT6 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Fam71bQ5STT6 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Fam71bQ5STT6 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Fam71bQ5STT6 Gm10010-201ENSMUST00000071101 2346 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Fam71bQ5STT6 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Fam71bQ5STT6 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Fam71bQ5STT6 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Fam71bQ5STT6 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Fam71bQ5STT6 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Fam71bQ5STT6 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Fam71bQ5STT6 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Fam71bQ5STT6 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Fam71bQ5STT6 Fam174a-202ENSMUST00000186780 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Fam71bQ5STT6 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Fam71bQ5STT6 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Fam71bQ5STT6 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Fam71bQ5STT6 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Fam71bQ5STT6 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Fam71bQ5STT6 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Fam71bQ5STT6 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Fam71bQ5STT6 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Fam71bQ5STT6 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Fam71bQ5STT6 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Fam71bQ5STT6 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Fam71bQ5STT6 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Fam71bQ5STT6 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Fam71bQ5STT6 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Fam71bQ5STT6 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Fam71bQ5STT6 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Fam71bQ5STT6 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
Fam71bQ5STT6 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Fam71bQ5STT6 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Fam71bQ5STT6 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Fam71bQ5STT6 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Fam71bQ5STT6 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Fam71bQ5STT6 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Fam71bQ5STT6 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Fam71bQ5STT6 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Fam71bQ5STT6 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Fam71bQ5STT6 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Fam71bQ5STT6 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Fam71bQ5STT6 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Fam71bQ5STT6 Gm44291-201ENSMUST00000203102 2865 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.6 ms