Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSW2

Psme4, Proteasome activator complex subunit 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,843 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psme4Q5SSW2 Hist1h2br-202ENSMUST00000110476 381 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Psme4Q5SSW2 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Psme4Q5SSW2 Olfr1344-201ENSMUST00000168341 1061 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Psme4Q5SSW2 AC140375.2-201ENSMUST00000225283 584 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Psme4Q5SSW2 Hist1h2bq-201ENSMUST00000078156 381 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Psme4Q5SSW2 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Psme4Q5SSW2 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Psme4Q5SSW2 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Psme4Q5SSW2 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Psme4Q5SSW2 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Psme4Q5SSW2 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Psme4Q5SSW2 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Psme4Q5SSW2 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Psme4Q5SSW2 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Psme4Q5SSW2 Lcn5-202ENSMUST00000100312 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Psme4Q5SSW2 Cmc2-202ENSMUST00000128304 394 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
Psme4Q5SSW2 2810408I11Rik-202ENSMUST00000150749 711 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Psme4Q5SSW2 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.5
Psme4Q5SSW2 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Psme4Q5SSW2 Gm6594-201ENSMUST00000097278 288 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.5
Psme4Q5SSW2 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Psme4Q5SSW2 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Psme4Q5SSW2 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Psme4Q5SSW2 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Psme4Q5SSW2 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Psme4Q5SSW2 Gm26769-201ENSMUST00000180469 619 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Psme4Q5SSW2 Gm42854-201ENSMUST00000201262 722 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Psme4Q5SSW2 CT025535.1-201ENSMUST00000227172 491 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Psme4Q5SSW2 Mesp1-201ENSMUST00000032760 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Psme4Q5SSW2 Ifng-201ENSMUST00000068592 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Psme4Q5SSW2 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Psme4Q5SSW2 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Psme4Q5SSW2 Adk-201ENSMUST00000045376 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Psme4Q5SSW2 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Psme4Q5SSW2 Trnt1-203ENSMUST00000113248 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Psme4Q5SSW2 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Psme4Q5SSW2 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Psme4Q5SSW2 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Psme4Q5SSW2 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Psme4Q5SSW2 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Psme4Q5SSW2 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Psme4Q5SSW2 Gm13015-201ENSMUST00000118674 204 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Psme4Q5SSW2 Pam16-201ENSMUST00000014445 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Psme4Q5SSW2 2010015M23Rik-201ENSMUST00000181900 1199 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Psme4Q5SSW2 4930573H18Rik-201ENSMUST00000197696 906 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Psme4Q5SSW2 Gm31816-201ENSMUST00000209388 1294 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Psme4Q5SSW2 Gm31105-201ENSMUST00000211421 687 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Psme4Q5SSW2 AI463170-203ENSMUST00000219353 430 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Psme4Q5SSW2 Lce1g-201ENSMUST00000029527 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Psme4Q5SSW2 Rpl10-ps2-201ENSMUST00000098432 645 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Psme4Q5SSW2 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Psme4Q5SSW2 Gm13613-201ENSMUST00000126240 1444 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Psme4Q5SSW2 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Psme4Q5SSW2 Sbk2-205ENSMUST00000208109 1422 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Psme4Q5SSW2 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Psme4Q5SSW2 Gm42934-201ENSMUST00000196920 1345 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Psme4Q5SSW2 Eef1akmt4-201ENSMUST00000115522 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Psme4Q5SSW2 Gm12017-201ENSMUST00000122453 1003 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Psme4Q5SSW2 Wdyhv1-203ENSMUST00000226889 394 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Psme4Q5SSW2 Commd9-201ENSMUST00000028584 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Psme4Q5SSW2 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Psme4Q5SSW2 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Psme4Q5SSW2 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Psme4Q5SSW2 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Psme4Q5SSW2 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Psme4Q5SSW2 Aifm2-202ENSMUST00000080099 1329 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Psme4Q5SSW2 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Psme4Q5SSW2 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Psme4Q5SSW2 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Psme4Q5SSW2 Gm16163-201ENSMUST00000161868 1119 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Psme4Q5SSW2 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Psme4Q5SSW2 Gm27618-201ENSMUST00000183671 60 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Psme4Q5SSW2 Gm27920-201ENSMUST00000183953 96 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Psme4Q5SSW2 Slc12a5-208ENSMUST00000202479 1202 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Psme4Q5SSW2 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Psme4Q5SSW2 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Psme4Q5SSW2 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Psme4Q5SSW2 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Psme4Q5SSW2 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Psme4Q5SSW2 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Psme4Q5SSW2 Efcab8-203ENSMUST00000175856 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Psme4Q5SSW2 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Psme4Q5SSW2 Lcn6-202ENSMUST00000114197 635 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Psme4Q5SSW2 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Psme4Q5SSW2 Ppt2-202ENSMUST00000166040 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Psme4Q5SSW2 Gm18737-201ENSMUST00000173594 937 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Psme4Q5SSW2 Gm27680-201ENSMUST00000184192 160 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Psme4Q5SSW2 Panct2-202ENSMUST00000188631 625 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Psme4Q5SSW2 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Psme4Q5SSW2 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Psme4Q5SSW2 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Psme4Q5SSW2 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Psme4Q5SSW2 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Psme4Q5SSW2 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Psme4Q5SSW2 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Psme4Q5SSW2 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Psme4Q5SSW2 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Psme4Q5SSW2 Cend1-204ENSMUST00000164387 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Psme4Q5SSW2 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Psme4Q5SSW2 Gm5866-201ENSMUST00000177881 973 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.3 ms