Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSN7

Sft2d1, Vesicle transport protein SFT2A, mousemouse

Predictions only

Length 159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sft2d1Q5SSN7 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Sft2d1Q5SSN7 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Sft2d1Q5SSN7 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Sft2d1Q5SSN7 Trib1-201ENSMUST00000067543 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Sft2d1Q5SSN7 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Sft2d1Q5SSN7 Mbp-203ENSMUST00000075372 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Sft2d1Q5SSN7 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Sft2d1Q5SSN7 Dis3-201ENSMUST00000042471 5150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Sft2d1Q5SSN7 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Sft2d1Q5SSN7 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Sft2d1Q5SSN7 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Sft2d1Q5SSN7 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Sft2d1Q5SSN7 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Sft2d1Q5SSN7 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Sft2d1Q5SSN7 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Sft2d1Q5SSN7 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Sft2d1Q5SSN7 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Sft2d1Q5SSN7 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Sft2d1Q5SSN7 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Sft2d1Q5SSN7 Map3k5-202ENSMUST00000120259 4289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Sft2d1Q5SSN7 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Sft2d1Q5SSN7 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Sft2d1Q5SSN7 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Sft2d1Q5SSN7 Sema6d-208ENSMUST00000103241 6157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Sft2d1Q5SSN7 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Sft2d1Q5SSN7 Osbpl8-201ENSMUST00000095310 3622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Sft2d1Q5SSN7 Slc25a25-203ENSMUST00000113307 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Sft2d1Q5SSN7 Cpeb3-208ENSMUST00000132580 3148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Sft2d1Q5SSN7 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Sft2d1Q5SSN7 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Sft2d1Q5SSN7 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Sft2d1Q5SSN7 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Sft2d1Q5SSN7 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Sft2d1Q5SSN7 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Sft2d1Q5SSN7 Fbxo41-201ENSMUST00000159062 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Sft2d1Q5SSN7 Ppip5k2-201ENSMUST00000042509 5882 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Sft2d1Q5SSN7 Gm2061-201ENSMUST00000180623 2761 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Sft2d1Q5SSN7 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Sft2d1Q5SSN7 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Sft2d1Q5SSN7 Fgfr3-201ENSMUST00000067150 4218 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Sft2d1Q5SSN7 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Sft2d1Q5SSN7 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Sft2d1Q5SSN7 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Sft2d1Q5SSN7 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Sft2d1Q5SSN7 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Sft2d1Q5SSN7 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Sft2d1Q5SSN7 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Sft2d1Q5SSN7 Mcc-202ENSMUST00000164666 3606 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Sft2d1Q5SSN7 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Sft2d1Q5SSN7 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Sft2d1Q5SSN7 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Sft2d1Q5SSN7 Gm43697-201ENSMUST00000199637 2581 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Sft2d1Q5SSN7 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Sft2d1Q5SSN7 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Sft2d1Q5SSN7 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Sft2d1Q5SSN7 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Sft2d1Q5SSN7 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Sft2d1Q5SSN7 Lpcat1-208ENSMUST00000223060 2141 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Sft2d1Q5SSN7 Hist1h2be-202ENSMUST00000091704 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Sft2d1Q5SSN7 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Sft2d1Q5SSN7 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Sft2d1Q5SSN7 Tap1-206ENSMUST00000170086 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Sft2d1Q5SSN7 Kif9-204ENSMUST00000198043 2233 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Sft2d1Q5SSN7 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Sft2d1Q5SSN7 Tomm6os-201ENSMUST00000155812 2944 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Sft2d1Q5SSN7 Gata2-201ENSMUST00000015197 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Sft2d1Q5SSN7 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Sft2d1Q5SSN7 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Sft2d1Q5SSN7 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Sft2d1Q5SSN7 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Sft2d1Q5SSN7 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Sft2d1Q5SSN7 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Sft2d1Q5SSN7 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Sft2d1Q5SSN7 Pnn-201ENSMUST00000021381 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Sft2d1Q5SSN7 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Sft2d1Q5SSN7 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Sft2d1Q5SSN7 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Sft2d1Q5SSN7 Dnajb2-210ENSMUST00000188931 3066 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Sft2d1Q5SSN7 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Sft2d1Q5SSN7 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Sft2d1Q5SSN7 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Sft2d1Q5SSN7 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Sft2d1Q5SSN7 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Sft2d1Q5SSN7 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Sft2d1Q5SSN7 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Sft2d1Q5SSN7 Pard3-202ENSMUST00000079777 3394 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Sft2d1Q5SSN7 Ralgapb-201ENSMUST00000046274 8366 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Sft2d1Q5SSN7 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Sft2d1Q5SSN7 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Sft2d1Q5SSN7 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Sft2d1Q5SSN7 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Sft2d1Q5SSN7 Arl11-202ENSMUST00000224727 2095 ntAPPRIS P1 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Sft2d1Q5SSN7 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Sft2d1Q5SSN7 Tmem39a-214ENSMUST00000171687 2667 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Sft2d1Q5SSN7 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Sft2d1Q5SSN7 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Sft2d1Q5SSN7 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Sft2d1Q5SSN7 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Sft2d1Q5SSN7 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Sft2d1Q5SSN7 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.3 ms