Protein–RNA interactions for Protein: Q5SS91

Sun3, SUN domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 320 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sun3Q5SS91 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Sun3Q5SS91 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Sun3Q5SS91 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Sun3Q5SS91 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Sun3Q5SS91 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Sun3Q5SS91 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Sun3Q5SS91 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Sun3Q5SS91 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Sun3Q5SS91 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Sun3Q5SS91 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Sun3Q5SS91 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Sun3Q5SS91 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Sun3Q5SS91 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Sun3Q5SS91 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Sun3Q5SS91 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Sun3Q5SS91 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Sun3Q5SS91 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Sun3Q5SS91 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Sun3Q5SS91 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Sun3Q5SS91 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Sun3Q5SS91 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Sun3Q5SS91 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Sun3Q5SS91 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Sun3Q5SS91 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Sun3Q5SS91 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Sun3Q5SS91 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Sun3Q5SS91 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Sun3Q5SS91 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Sun3Q5SS91 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Sun3Q5SS91 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Sun3Q5SS91 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Sun3Q5SS91 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Sun3Q5SS91 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Sun3Q5SS91 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Sun3Q5SS91 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Sun3Q5SS91 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Sun3Q5SS91 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Sun3Q5SS91 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Sun3Q5SS91 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Sun3Q5SS91 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Sun3Q5SS91 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Sun3Q5SS91 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Sun3Q5SS91 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Sun3Q5SS91 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Sun3Q5SS91 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Sun3Q5SS91 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Sun3Q5SS91 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Sun3Q5SS91 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Sun3Q5SS91 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Sun3Q5SS91 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Sun3Q5SS91 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Sun3Q5SS91 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Sun3Q5SS91 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Sun3Q5SS91 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Sun3Q5SS91 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Sun3Q5SS91 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Sun3Q5SS91 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Sun3Q5SS91 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Sun3Q5SS91 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Sun3Q5SS91 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Sun3Q5SS91 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Sun3Q5SS91 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Sun3Q5SS91 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Sun3Q5SS91 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Sun3Q5SS91 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Sun3Q5SS91 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Sun3Q5SS91 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Sun3Q5SS91 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Sun3Q5SS91 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Sun3Q5SS91 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Sun3Q5SS91 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Sun3Q5SS91 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Sun3Q5SS91 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Sun3Q5SS91 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Sun3Q5SS91 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Sun3Q5SS91 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Sun3Q5SS91 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Sun3Q5SS91 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Sun3Q5SS91 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Sun3Q5SS91 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Sun3Q5SS91 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Sun3Q5SS91 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Sun3Q5SS91 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Sun3Q5SS91 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Sun3Q5SS91 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Sun3Q5SS91 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Sun3Q5SS91 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Sun3Q5SS91 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Sun3Q5SS91 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Sun3Q5SS91 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Sun3Q5SS91 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Sun3Q5SS91 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Sun3Q5SS91 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Sun3Q5SS91 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Sun3Q5SS91 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Sun3Q5SS91 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Sun3Q5SS91 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Sun3Q5SS91 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Sun3Q5SS91 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Sun3Q5SS91 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.3 ms