Protein–RNA interactions for Protein: Q5RJB0

Bhlha9, Class A basic helix-loop-helix protein 9, mousemouse

Predictions only

Length 231 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bhlha9Q5RJB0 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Bhlha9Q5RJB0 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Bhlha9Q5RJB0 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Bhlha9Q5RJB0 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Bhlha9Q5RJB0 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Bhlha9Q5RJB0 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Bhlha9Q5RJB0 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Bhlha9Q5RJB0 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Bhlha9Q5RJB0 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Bhlha9Q5RJB0 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Bhlha9Q5RJB0 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Bhlha9Q5RJB0 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Bhlha9Q5RJB0 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Bhlha9Q5RJB0 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Bhlha9Q5RJB0 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Bhlha9Q5RJB0 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Bhlha9Q5RJB0 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Bhlha9Q5RJB0 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Bhlha9Q5RJB0 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Bhlha9Q5RJB0 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Bhlha9Q5RJB0 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Bhlha9Q5RJB0 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Bhlha9Q5RJB0 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Bhlha9Q5RJB0 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Bhlha9Q5RJB0 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Bhlha9Q5RJB0 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Bhlha9Q5RJB0 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Bhlha9Q5RJB0 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Bhlha9Q5RJB0 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Bhlha9Q5RJB0 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Bhlha9Q5RJB0 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Bhlha9Q5RJB0 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Bhlha9Q5RJB0 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Bhlha9Q5RJB0 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Bhlha9Q5RJB0 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Bhlha9Q5RJB0 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Bhlha9Q5RJB0 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Bhlha9Q5RJB0 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Bhlha9Q5RJB0 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Bhlha9Q5RJB0 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Bhlha9Q5RJB0 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Bhlha9Q5RJB0 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Bhlha9Q5RJB0 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Bhlha9Q5RJB0 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Bhlha9Q5RJB0 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Bhlha9Q5RJB0 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Bhlha9Q5RJB0 Gm37912-201ENSMUST00000191895 3076 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Bhlha9Q5RJB0 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Bhlha9Q5RJB0 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Bhlha9Q5RJB0 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Bhlha9Q5RJB0 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Bhlha9Q5RJB0 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Bhlha9Q5RJB0 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Bhlha9Q5RJB0 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Bhlha9Q5RJB0 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Bhlha9Q5RJB0 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Bhlha9Q5RJB0 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Bhlha9Q5RJB0 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Bhlha9Q5RJB0 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Bhlha9Q5RJB0 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Bhlha9Q5RJB0 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Bhlha9Q5RJB0 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Bhlha9Q5RJB0 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Bhlha9Q5RJB0 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Bhlha9Q5RJB0 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Bhlha9Q5RJB0 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Bhlha9Q5RJB0 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Bhlha9Q5RJB0 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Bhlha9Q5RJB0 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Bhlha9Q5RJB0 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Bhlha9Q5RJB0 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Bhlha9Q5RJB0 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Bhlha9Q5RJB0 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Bhlha9Q5RJB0 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Bhlha9Q5RJB0 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Bhlha9Q5RJB0 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Bhlha9Q5RJB0 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Bhlha9Q5RJB0 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Bhlha9Q5RJB0 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Bhlha9Q5RJB0 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Bhlha9Q5RJB0 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Bhlha9Q5RJB0 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Bhlha9Q5RJB0 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Bhlha9Q5RJB0 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Bhlha9Q5RJB0 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Bhlha9Q5RJB0 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Bhlha9Q5RJB0 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Bhlha9Q5RJB0 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Bhlha9Q5RJB0 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Bhlha9Q5RJB0 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Bhlha9Q5RJB0 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Bhlha9Q5RJB0 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Bhlha9Q5RJB0 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Bhlha9Q5RJB0 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Bhlha9Q5RJB0 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Bhlha9Q5RJB0 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Bhlha9Q5RJB0 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Bhlha9Q5RJB0 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Bhlha9Q5RJB0 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Bhlha9Q5RJB0 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30 ms