Protein–RNA interactions for Protein: Q5R1A4

Trdv2-2, T cell receptor delta variable 2-2 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 116 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trdv2-2Q5R1A4 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Trdv2-2Q5R1A4 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Trdv2-2Q5R1A4 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Trdv2-2Q5R1A4 Pard3b-202ENSMUST00000075374 8392 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Trdv2-2Q5R1A4 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Trdv2-2Q5R1A4 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Trdv2-2Q5R1A4 Synj1-203ENSMUST00000121759 7090 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Trdv2-2Q5R1A4 Dhx9-201ENSMUST00000042141 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Trdv2-2Q5R1A4 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Trdv2-2Q5R1A4 Diaph2-207ENSMUST00000167619 8439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Trdv2-2Q5R1A4 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Trdv2-2Q5R1A4 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Trdv2-2Q5R1A4 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
Trdv2-2Q5R1A4 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Trdv2-2Q5R1A4 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Trdv2-2Q5R1A4 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Trdv2-2Q5R1A4 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Trdv2-2Q5R1A4 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Trdv2-2Q5R1A4 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
Trdv2-2Q5R1A4 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Trdv2-2Q5R1A4 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Trdv2-2Q5R1A4 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Trdv2-2Q5R1A4 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Trdv2-2Q5R1A4 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Trdv2-2Q5R1A4 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Trdv2-2Q5R1A4 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Trdv2-2Q5R1A4 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Trdv2-2Q5R1A4 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Trdv2-2Q5R1A4 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
Trdv2-2Q5R1A4 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Trdv2-2Q5R1A4 Sema6d-208ENSMUST00000103241 6157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Trdv2-2Q5R1A4 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Trdv2-2Q5R1A4 Tpr-201ENSMUST00000119161 7480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Trdv2-2Q5R1A4 Ttc3-201ENSMUST00000117648 7417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Trdv2-2Q5R1A4 Iqgap1-201ENSMUST00000167377 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Trdv2-2Q5R1A4 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Trdv2-2Q5R1A4 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Trdv2-2Q5R1A4 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Trdv2-2Q5R1A4 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Trdv2-2Q5R1A4 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Trdv2-2Q5R1A4 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Trdv2-2Q5R1A4 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Trdv2-2Q5R1A4 Gm37912-201ENSMUST00000191895 3076 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Trdv2-2Q5R1A4 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Trdv2-2Q5R1A4 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Trdv2-2Q5R1A4 Dis3-201ENSMUST00000042471 5150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Trdv2-2Q5R1A4 Tsc2-205ENSMUST00000226398 5459 ntAPPRIS P2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Trdv2-2Q5R1A4 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Trdv2-2Q5R1A4 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Trdv2-2Q5R1A4 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Trdv2-2Q5R1A4 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Trdv2-2Q5R1A4 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Trdv2-2Q5R1A4 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Trdv2-2Q5R1A4 Wdfy3-206ENSMUST00000174698 3858 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Trdv2-2Q5R1A4 Loxl2-201ENSMUST00000022660 5316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Trdv2-2Q5R1A4 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Trdv2-2Q5R1A4 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Trdv2-2Q5R1A4 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Trdv2-2Q5R1A4 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Trdv2-2Q5R1A4 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Trdv2-2Q5R1A4 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Trdv2-2Q5R1A4 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Trdv2-2Q5R1A4 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Trdv2-2Q5R1A4 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Trdv2-2Q5R1A4 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Trdv2-2Q5R1A4 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Trdv2-2Q5R1A4 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Trdv2-2Q5R1A4 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Trdv2-2Q5R1A4 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Trdv2-2Q5R1A4 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Trdv2-2Q5R1A4 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Trdv2-2Q5R1A4 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Trdv2-2Q5R1A4 Arap2-201ENSMUST00000076623 7306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Trdv2-2Q5R1A4 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Trdv2-2Q5R1A4 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Trdv2-2Q5R1A4 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Trdv2-2Q5R1A4 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Trdv2-2Q5R1A4 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Trdv2-2Q5R1A4 Dhx34-203ENSMUST00000119102 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Trdv2-2Q5R1A4 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Trdv2-2Q5R1A4 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Trdv2-2Q5R1A4 Grin3a-201ENSMUST00000076674 7431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Trdv2-2Q5R1A4 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Trdv2-2Q5R1A4 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Trdv2-2Q5R1A4 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Trdv2-2Q5R1A4 Dennd5b-201ENSMUST00000111557 9831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Trdv2-2Q5R1A4 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Trdv2-2Q5R1A4 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Trdv2-2Q5R1A4 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Trdv2-2Q5R1A4 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Trdv2-2Q5R1A4 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Trdv2-2Q5R1A4 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Trdv2-2Q5R1A4 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Trdv2-2Q5R1A4 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Trdv2-2Q5R1A4 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Trdv2-2Q5R1A4 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Trdv2-2Q5R1A4 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Trdv2-2Q5R1A4 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Trdv2-2Q5R1A4 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Trdv2-2Q5R1A4 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.1 ms