Protein–RNA interactions for Protein: Q5R1A3

Trdv4, T cell receptor delta variable 4 (Fragment), mousemouse

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Length 115 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trdv4Q5R1A3 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Trdv4Q5R1A3 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Trdv4Q5R1A3 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Trdv4Q5R1A3 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Trdv4Q5R1A3 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Trdv4Q5R1A3 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Trdv4Q5R1A3 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Trdv4Q5R1A3 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Trdv4Q5R1A3 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Trdv4Q5R1A3 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Trdv4Q5R1A3 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Trdv4Q5R1A3 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Trdv4Q5R1A3 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Trdv4Q5R1A3 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Trdv4Q5R1A3 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Trdv4Q5R1A3 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Trdv4Q5R1A3 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Trdv4Q5R1A3 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Trdv4Q5R1A3 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Trdv4Q5R1A3 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Trdv4Q5R1A3 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Trdv4Q5R1A3 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Trdv4Q5R1A3 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Trdv4Q5R1A3 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Trdv4Q5R1A3 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Trdv4Q5R1A3 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Trdv4Q5R1A3 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Trdv4Q5R1A3 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Trdv4Q5R1A3 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Trdv4Q5R1A3 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Trdv4Q5R1A3 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Trdv4Q5R1A3 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Trdv4Q5R1A3 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Trdv4Q5R1A3 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Trdv4Q5R1A3 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Trdv4Q5R1A3 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Trdv4Q5R1A3 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Trdv4Q5R1A3 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Trdv4Q5R1A3 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Trdv4Q5R1A3 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Trdv4Q5R1A3 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Trdv4Q5R1A3 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Trdv4Q5R1A3 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Trdv4Q5R1A3 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Trdv4Q5R1A3 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Trdv4Q5R1A3 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Trdv4Q5R1A3 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Trdv4Q5R1A3 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Trdv4Q5R1A3 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Trdv4Q5R1A3 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Trdv4Q5R1A3 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Trdv4Q5R1A3 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Trdv4Q5R1A3 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Trdv4Q5R1A3 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Trdv4Q5R1A3 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Trdv4Q5R1A3 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Trdv4Q5R1A3 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Trdv4Q5R1A3 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Trdv4Q5R1A3 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Trdv4Q5R1A3 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Trdv4Q5R1A3 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Trdv4Q5R1A3 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Trdv4Q5R1A3 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Trdv4Q5R1A3 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Trdv4Q5R1A3 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Trdv4Q5R1A3 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Trdv4Q5R1A3 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Trdv4Q5R1A3 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Trdv4Q5R1A3 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Trdv4Q5R1A3 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Trdv4Q5R1A3 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Trdv4Q5R1A3 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Trdv4Q5R1A3 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Trdv4Q5R1A3 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Trdv4Q5R1A3 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Trdv4Q5R1A3 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Trdv4Q5R1A3 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Trdv4Q5R1A3 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Trdv4Q5R1A3 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Trdv4Q5R1A3 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Trdv4Q5R1A3 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Trdv4Q5R1A3 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Trdv4Q5R1A3 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Trdv4Q5R1A3 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Trdv4Q5R1A3 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Trdv4Q5R1A3 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Trdv4Q5R1A3 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Trdv4Q5R1A3 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Trdv4Q5R1A3 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Trdv4Q5R1A3 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Trdv4Q5R1A3 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Trdv4Q5R1A3 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Trdv4Q5R1A3 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Trdv4Q5R1A3 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Trdv4Q5R1A3 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Trdv4Q5R1A3 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Trdv4Q5R1A3 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Trdv4Q5R1A3 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Trdv4Q5R1A3 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Trdv4Q5R1A3 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
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