Protein–RNA interactions for Protein: Q5QGU6

Rtp3, Receptor-transporting protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 474 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rtp3Q5QGU6 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rtp3Q5QGU6 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rtp3Q5QGU6 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rtp3Q5QGU6 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Rtp3Q5QGU6 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rtp3Q5QGU6 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Rtp3Q5QGU6 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rtp3Q5QGU6 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rtp3Q5QGU6 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rtp3Q5QGU6 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rtp3Q5QGU6 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rtp3Q5QGU6 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rtp3Q5QGU6 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rtp3Q5QGU6 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rtp3Q5QGU6 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rtp3Q5QGU6 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rtp3Q5QGU6 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rtp3Q5QGU6 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rtp3Q5QGU6 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rtp3Q5QGU6 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rtp3Q5QGU6 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rtp3Q5QGU6 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rtp3Q5QGU6 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rtp3Q5QGU6 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rtp3Q5QGU6 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rtp3Q5QGU6 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rtp3Q5QGU6 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rtp3Q5QGU6 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rtp3Q5QGU6 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rtp3Q5QGU6 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rtp3Q5QGU6 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rtp3Q5QGU6 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rtp3Q5QGU6 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rtp3Q5QGU6 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Rtp3Q5QGU6 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rtp3Q5QGU6 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rtp3Q5QGU6 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Rtp3Q5QGU6 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rtp3Q5QGU6 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Rtp3Q5QGU6 mt-Rnr1-201ENSMUST00000082388 955 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Rtp3Q5QGU6 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rtp3Q5QGU6 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rtp3Q5QGU6 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rtp3Q5QGU6 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rtp3Q5QGU6 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rtp3Q5QGU6 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rtp3Q5QGU6 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rtp3Q5QGU6 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rtp3Q5QGU6 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rtp3Q5QGU6 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rtp3Q5QGU6 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rtp3Q5QGU6 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rtp3Q5QGU6 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rtp3Q5QGU6 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rtp3Q5QGU6 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rtp3Q5QGU6 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rtp3Q5QGU6 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Rtp3Q5QGU6 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rtp3Q5QGU6 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rtp3Q5QGU6 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rtp3Q5QGU6 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rtp3Q5QGU6 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rtp3Q5QGU6 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rtp3Q5QGU6 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rtp3Q5QGU6 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rtp3Q5QGU6 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rtp3Q5QGU6 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rtp3Q5QGU6 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rtp3Q5QGU6 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rtp3Q5QGU6 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rtp3Q5QGU6 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rtp3Q5QGU6 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rtp3Q5QGU6 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rtp3Q5QGU6 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Rtp3Q5QGU6 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Rtp3Q5QGU6 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Rtp3Q5QGU6 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Rtp3Q5QGU6 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Rtp3Q5QGU6 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Rtp3Q5QGU6 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Rtp3Q5QGU6 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Rtp3Q5QGU6 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Rtp3Q5QGU6 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Rtp3Q5QGU6 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Rtp3Q5QGU6 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Rtp3Q5QGU6 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Rtp3Q5QGU6 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Rtp3Q5QGU6 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Rtp3Q5QGU6 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Rtp3Q5QGU6 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Rtp3Q5QGU6 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Rtp3Q5QGU6 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Rtp3Q5QGU6 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Rtp3Q5QGU6 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Rtp3Q5QGU6 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Rtp3Q5QGU6 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Rtp3Q5QGU6 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Rtp3Q5QGU6 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Rtp3Q5QGU6 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC13.71□□□□□ -0.22
Rtp3Q5QGU6 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.4 ms