Protein–RNA interactions for Protein: Q5NCF2

Trappc1, Trafficking protein particle complex subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 145 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc1Q5NCF2 Dnmt3b-202ENSMUST00000072997 4208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Trappc1Q5NCF2 Map7d1-201ENSMUST00000061143 3351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Trappc1Q5NCF2 Gm38391-201ENSMUST00000191720 4069 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Trappc1Q5NCF2 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Trappc1Q5NCF2 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Trappc1Q5NCF2 Dzip1-202ENSMUST00000047208 4476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Trappc1Q5NCF2 Zcchc3-201ENSMUST00000099207 3073 ntAPPRIS P1 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Trappc1Q5NCF2 Ube2k-210ENSMUST00000202679 4682 ntTSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Trappc1Q5NCF2 Cep126-201ENSMUST00000037397 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Trappc1Q5NCF2 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Trappc1Q5NCF2 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Trappc1Q5NCF2 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Trappc1Q5NCF2 Brd2-201ENSMUST00000025193 4374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Trappc1Q5NCF2 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Trappc1Q5NCF2 Zfp346-201ENSMUST00000021937 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Trappc1Q5NCF2 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Trappc1Q5NCF2 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Trappc1Q5NCF2 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Trappc1Q5NCF2 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Trappc1Q5NCF2 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Trappc1Q5NCF2 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Trappc1Q5NCF2 Sh2b3-202ENSMUST00000086310 4195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Trappc1Q5NCF2 Capn7-201ENSMUST00000022451 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Trappc1Q5NCF2 Srp68-202ENSMUST00000106425 2330 ntTSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Trappc1Q5NCF2 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Trappc1Q5NCF2 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Trappc1Q5NCF2 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Trappc1Q5NCF2 Iws1-201ENSMUST00000025243 9613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Trappc1Q5NCF2 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Trappc1Q5NCF2 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Trappc1Q5NCF2 Pars2-201ENSMUST00000058905 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Trappc1Q5NCF2 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Trappc1Q5NCF2 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Trappc1Q5NCF2 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Trappc1Q5NCF2 Pprc1-202ENSMUST00000099392 3956 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Trappc1Q5NCF2 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Trappc1Q5NCF2 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Trappc1Q5NCF2 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
Trappc1Q5NCF2 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Trappc1Q5NCF2 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Trappc1Q5NCF2 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Trappc1Q5NCF2 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Trappc1Q5NCF2 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Trappc1Q5NCF2 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Trappc1Q5NCF2 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Trappc1Q5NCF2 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Trappc1Q5NCF2 Rasal3-207ENSMUST00000137458 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Trappc1Q5NCF2 Trim27-206ENSMUST00000222544 4312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Trappc1Q5NCF2 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Trappc1Q5NCF2 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Trappc1Q5NCF2 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Trappc1Q5NCF2 Olfr683-202ENSMUST00000209879 3841 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Trappc1Q5NCF2 Gpr85-201ENSMUST00000060442 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Trappc1Q5NCF2 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Trappc1Q5NCF2 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Trappc1Q5NCF2 Fxyd3-205ENSMUST00000167369 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Trappc1Q5NCF2 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Trappc1Q5NCF2 Bet1l-201ENSMUST00000026557 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Trappc1Q5NCF2 Gtf2ird1-201ENSMUST00000073161 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Trappc1Q5NCF2 Slc4a1-201ENSMUST00000006749 4545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Trappc1Q5NCF2 Robo4-205ENSMUST00000214185 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Trappc1Q5NCF2 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Trappc1Q5NCF2 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Trappc1Q5NCF2 Epha1-201ENSMUST00000073387 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Trappc1Q5NCF2 Fam169b-206ENSMUST00000210558 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Trappc1Q5NCF2 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Trappc1Q5NCF2 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Trappc1Q5NCF2 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Trappc1Q5NCF2 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Trappc1Q5NCF2 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Trappc1Q5NCF2 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
Trappc1Q5NCF2 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
Trappc1Q5NCF2 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Trappc1Q5NCF2 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Trappc1Q5NCF2 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Trappc1Q5NCF2 AC167013.2-201ENSMUST00000228520 2684 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
Trappc1Q5NCF2 Dlx6-202ENSMUST00000160937 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Trappc1Q5NCF2 Pcnx3-201ENSMUST00000068169 5276 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Trappc1Q5NCF2 Ccdc8-201ENSMUST00000094805 4809 ntAPPRIS P1 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Trappc1Q5NCF2 Leng9-201ENSMUST00000058358 2460 ntAPPRIS P1 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Trappc1Q5NCF2 Pde12-201ENSMUST00000052932 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Trappc1Q5NCF2 Tc2n-203ENSMUST00000160830 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Trappc1Q5NCF2 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Trappc1Q5NCF2 Plekhn1-201ENSMUST00000105569 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Trappc1Q5NCF2 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Trappc1Q5NCF2 Adamts16-201ENSMUST00000080145 4981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Trappc1Q5NCF2 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Trappc1Q5NCF2 Mavs-202ENSMUST00000110199 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Trappc1Q5NCF2 Mllt10-203ENSMUST00000114671 5063 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Trappc1Q5NCF2 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Trappc1Q5NCF2 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Trappc1Q5NCF2 Proser2-202ENSMUST00000114942 4398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Trappc1Q5NCF2 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Trappc1Q5NCF2 Gm45504-201ENSMUST00000211407 2107 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
Trappc1Q5NCF2 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Trappc1Q5NCF2 Sesn1-201ENSMUST00000041438 2600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Trappc1Q5NCF2 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Trappc1Q5NCF2 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Trappc1Q5NCF2 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Trappc1Q5NCF2 Crem-201ENSMUST00000025069 2931 ntTSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.4 ms