Protein–RNA interactions for Protein: Q5NCC3

Trim41, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM41, mousemouse

Predictions only

Length 630 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim41Q5NCC3 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Trim41Q5NCC3 4930478K11Rik-201ENSMUST00000181875 715 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Trim41Q5NCC3 AC125206.2-201ENSMUST00000217454 574 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
Trim41Q5NCC3 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Trim41Q5NCC3 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Trim41Q5NCC3 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Trim41Q5NCC3 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Trim41Q5NCC3 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Trim41Q5NCC3 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Trim41Q5NCC3 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.96
Trim41Q5NCC3 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Trim41Q5NCC3 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC27.32■■□□□ 1.96
Trim41Q5NCC3 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Trim41Q5NCC3 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Trim41Q5NCC3 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Trim41Q5NCC3 Acvr1c-203ENSMUST00000112607 1266 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
Trim41Q5NCC3 Gm5312-201ENSMUST00000203728 547 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
Trim41Q5NCC3 Rps15-201ENSMUST00000062674 572 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Trim41Q5NCC3 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Trim41Q5NCC3 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Trim41Q5NCC3 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
Trim41Q5NCC3 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Trim41Q5NCC3 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Trim41Q5NCC3 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Trim41Q5NCC3 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Trim41Q5NCC3 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Trim41Q5NCC3 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC27.31■■□□□ 1.96
Trim41Q5NCC3 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Trim41Q5NCC3 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Trim41Q5NCC3 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Trim41Q5NCC3 Mtmr2-209ENSMUST00000156801 617 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
Trim41Q5NCC3 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
Trim41Q5NCC3 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC27.31■■□□□ 1.96
Trim41Q5NCC3 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
Trim41Q5NCC3 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Trim41Q5NCC3 Phyhd1-204ENSMUST00000113645 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Trim41Q5NCC3 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Trim41Q5NCC3 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
Trim41Q5NCC3 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
Trim41Q5NCC3 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Trim41Q5NCC3 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
Trim41Q5NCC3 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Trim41Q5NCC3 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Trim41Q5NCC3 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
Trim41Q5NCC3 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Trim41Q5NCC3 Gm5089-201ENSMUST00000081580 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Trim41Q5NCC3 Runx2os2-201ENSMUST00000161664 818 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Trim41Q5NCC3 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
Trim41Q5NCC3 Gm38319-201ENSMUST00000194537 1266 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
Trim41Q5NCC3 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Trim41Q5NCC3 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Trim41Q5NCC3 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Trim41Q5NCC3 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
Trim41Q5NCC3 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
Trim41Q5NCC3 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Trim41Q5NCC3 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Trim41Q5NCC3 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Trim41Q5NCC3 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
Trim41Q5NCC3 Snx24-201ENSMUST00000025417 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Trim41Q5NCC3 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Trim41Q5NCC3 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Trim41Q5NCC3 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Trim41Q5NCC3 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Trim41Q5NCC3 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Trim41Q5NCC3 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Trim41Q5NCC3 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
Trim41Q5NCC3 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Trim41Q5NCC3 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
Trim41Q5NCC3 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Trim41Q5NCC3 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Trim41Q5NCC3 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Trim41Q5NCC3 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC27.29■■□□□ 1.96
Trim41Q5NCC3 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Trim41Q5NCC3 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Trim41Q5NCC3 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Trim41Q5NCC3 Plekhb1-202ENSMUST00000107043 931 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
Trim41Q5NCC3 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
Trim41Q5NCC3 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
Trim41Q5NCC3 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
Trim41Q5NCC3 Gm34866-201ENSMUST00000196146 515 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Trim41Q5NCC3 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Trim41Q5NCC3 Pcna-ps2-201ENSMUST00000088040 1257 ntAPPRIS P1 BASIC27.28■■□□□ 1.96
Trim41Q5NCC3 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Trim41Q5NCC3 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Trim41Q5NCC3 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Trim41Q5NCC3 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Trim41Q5NCC3 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Trim41Q5NCC3 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Trim41Q5NCC3 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Trim41Q5NCC3 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Trim41Q5NCC3 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Trim41Q5NCC3 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Trim41Q5NCC3 1700037H04Rik-202ENSMUST00000103188 1241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Trim41Q5NCC3 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC27.27■■□□□ 1.96
Trim41Q5NCC3 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Trim41Q5NCC3 Gm37444-201ENSMUST00000193605 439 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
Trim41Q5NCC3 Tmem38a-203ENSMUST00000212763 882 ntTSL 3 BASIC27.27■■□□□ 1.96
Trim41Q5NCC3 AC132467.2-202ENSMUST00000227726 559 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
Trim41Q5NCC3 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Trim41Q5NCC3 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.2 ms