Protein–RNA interactions for Protein: Q5DTW2

Sfmbt2, Scm-like with four MBT domains protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 938 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sfmbt2Q5DTW2 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sfmbt2Q5DTW2 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sfmbt2Q5DTW2 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Sfmbt2Q5DTW2 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Sfmbt2Q5DTW2 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sfmbt2Q5DTW2 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sfmbt2Q5DTW2 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sfmbt2Q5DTW2 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sfmbt2Q5DTW2 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sfmbt2Q5DTW2 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sfmbt2Q5DTW2 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sfmbt2Q5DTW2 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sfmbt2Q5DTW2 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Sfmbt2Q5DTW2 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sfmbt2Q5DTW2 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sfmbt2Q5DTW2 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sfmbt2Q5DTW2 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sfmbt2Q5DTW2 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sfmbt2Q5DTW2 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sfmbt2Q5DTW2 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sfmbt2Q5DTW2 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sfmbt2Q5DTW2 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sfmbt2Q5DTW2 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sfmbt2Q5DTW2 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sfmbt2Q5DTW2 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sfmbt2Q5DTW2 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sfmbt2Q5DTW2 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sfmbt2Q5DTW2 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sfmbt2Q5DTW2 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sfmbt2Q5DTW2 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sfmbt2Q5DTW2 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sfmbt2Q5DTW2 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sfmbt2Q5DTW2 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sfmbt2Q5DTW2 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sfmbt2Q5DTW2 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sfmbt2Q5DTW2 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sfmbt2Q5DTW2 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sfmbt2Q5DTW2 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sfmbt2Q5DTW2 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sfmbt2Q5DTW2 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sfmbt2Q5DTW2 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sfmbt2Q5DTW2 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sfmbt2Q5DTW2 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sfmbt2Q5DTW2 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sfmbt2Q5DTW2 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sfmbt2Q5DTW2 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sfmbt2Q5DTW2 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sfmbt2Q5DTW2 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sfmbt2Q5DTW2 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sfmbt2Q5DTW2 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sfmbt2Q5DTW2 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sfmbt2Q5DTW2 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sfmbt2Q5DTW2 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sfmbt2Q5DTW2 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sfmbt2Q5DTW2 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sfmbt2Q5DTW2 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sfmbt2Q5DTW2 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sfmbt2Q5DTW2 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Sfmbt2Q5DTW2 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sfmbt2Q5DTW2 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sfmbt2Q5DTW2 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sfmbt2Q5DTW2 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sfmbt2Q5DTW2 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sfmbt2Q5DTW2 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sfmbt2Q5DTW2 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sfmbt2Q5DTW2 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sfmbt2Q5DTW2 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sfmbt2Q5DTW2 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sfmbt2Q5DTW2 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sfmbt2Q5DTW2 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sfmbt2Q5DTW2 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sfmbt2Q5DTW2 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sfmbt2Q5DTW2 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sfmbt2Q5DTW2 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sfmbt2Q5DTW2 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sfmbt2Q5DTW2 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sfmbt2Q5DTW2 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sfmbt2Q5DTW2 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sfmbt2Q5DTW2 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sfmbt2Q5DTW2 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sfmbt2Q5DTW2 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sfmbt2Q5DTW2 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Sfmbt2Q5DTW2 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sfmbt2Q5DTW2 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sfmbt2Q5DTW2 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sfmbt2Q5DTW2 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sfmbt2Q5DTW2 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sfmbt2Q5DTW2 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sfmbt2Q5DTW2 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sfmbt2Q5DTW2 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sfmbt2Q5DTW2 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sfmbt2Q5DTW2 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sfmbt2Q5DTW2 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sfmbt2Q5DTW2 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sfmbt2Q5DTW2 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sfmbt2Q5DTW2 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sfmbt2Q5DTW2 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sfmbt2Q5DTW2 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sfmbt2Q5DTW2 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sfmbt2Q5DTW2 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.4 ms