Protein–RNA interactions for Protein: Q571B6

Whamm, WASP homolog-associated protein with actin, membranes and microtubules, mousemouse

Predictions only

Length 793 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WhammQ571B6 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
WhammQ571B6 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
WhammQ571B6 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
WhammQ571B6 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
WhammQ571B6 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
WhammQ571B6 Yod1-201ENSMUST00000049813 6128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
WhammQ571B6 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
WhammQ571B6 Wdfy3-206ENSMUST00000174698 3858 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
WhammQ571B6 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
WhammQ571B6 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
WhammQ571B6 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
WhammQ571B6 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
WhammQ571B6 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
WhammQ571B6 Slc4a5-202ENSMUST00000113899 5039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
WhammQ571B6 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
WhammQ571B6 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
WhammQ571B6 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
WhammQ571B6 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
WhammQ571B6 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
WhammQ571B6 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
WhammQ571B6 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
WhammQ571B6 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
WhammQ571B6 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
WhammQ571B6 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
WhammQ571B6 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
WhammQ571B6 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
WhammQ571B6 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
WhammQ571B6 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
WhammQ571B6 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
WhammQ571B6 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
WhammQ571B6 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
WhammQ571B6 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
WhammQ571B6 Mybl1-201ENSMUST00000088658 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
WhammQ571B6 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
WhammQ571B6 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
WhammQ571B6 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
WhammQ571B6 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
WhammQ571B6 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
WhammQ571B6 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
WhammQ571B6 Pafah1b1-202ENSMUST00000102520 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
WhammQ571B6 Gapvd1-202ENSMUST00000102800 8339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
WhammQ571B6 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
WhammQ571B6 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
WhammQ571B6 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
WhammQ571B6 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
WhammQ571B6 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
WhammQ571B6 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
WhammQ571B6 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
WhammQ571B6 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
WhammQ571B6 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
WhammQ571B6 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
WhammQ571B6 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
WhammQ571B6 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
WhammQ571B6 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
WhammQ571B6 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
WhammQ571B6 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
WhammQ571B6 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
WhammQ571B6 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
WhammQ571B6 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
WhammQ571B6 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
WhammQ571B6 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
WhammQ571B6 Nacc2-201ENSMUST00000028300 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
WhammQ571B6 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
WhammQ571B6 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
WhammQ571B6 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
WhammQ571B6 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
WhammQ571B6 Eif4g1-204ENSMUST00000115460 5638 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
WhammQ571B6 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
WhammQ571B6 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
WhammQ571B6 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
WhammQ571B6 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
WhammQ571B6 Rbm26-201ENSMUST00000022715 3633 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
WhammQ571B6 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
WhammQ571B6 Ppip5k2-201ENSMUST00000042509 5882 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
WhammQ571B6 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
WhammQ571B6 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
WhammQ571B6 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
WhammQ571B6 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
WhammQ571B6 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
WhammQ571B6 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
WhammQ571B6 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
WhammQ571B6 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
WhammQ571B6 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
WhammQ571B6 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
WhammQ571B6 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
WhammQ571B6 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
WhammQ571B6 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
WhammQ571B6 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
WhammQ571B6 Tdrd6-203ENSMUST00000168073 7062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
WhammQ571B6 Tdrd6-201ENSMUST00000045717 7055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
WhammQ571B6 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
WhammQ571B6 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
WhammQ571B6 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
WhammQ571B6 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
WhammQ571B6 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
WhammQ571B6 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
WhammQ571B6 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
WhammQ571B6 Gpr88-201ENSMUST00000090473 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
WhammQ571B6 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
WhammQ571B6 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.2 ms