Protein–RNA interactions for Protein: Q56A04

Eme2, Probable crossover junction endonuclease EME2, mousemouse

Predictions only

Length 373 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Eme2Q56A04 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Eme2Q56A04 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Eme2Q56A04 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Eme2Q56A04 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Eme2Q56A04 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Eme2Q56A04 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Eme2Q56A04 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Eme2Q56A04 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Eme2Q56A04 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Eme2Q56A04 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Eme2Q56A04 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Eme2Q56A04 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Eme2Q56A04 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Eme2Q56A04 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Eme2Q56A04 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Eme2Q56A04 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Eme2Q56A04 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Eme2Q56A04 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Eme2Q56A04 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Eme2Q56A04 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Eme2Q56A04 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Eme2Q56A04 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Eme2Q56A04 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Eme2Q56A04 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Eme2Q56A04 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Eme2Q56A04 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Eme2Q56A04 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Eme2Q56A04 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Eme2Q56A04 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Eme2Q56A04 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Eme2Q56A04 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Eme2Q56A04 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Eme2Q56A04 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Eme2Q56A04 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Eme2Q56A04 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Eme2Q56A04 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Eme2Q56A04 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Eme2Q56A04 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Eme2Q56A04 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Eme2Q56A04 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Eme2Q56A04 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Eme2Q56A04 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Eme2Q56A04 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Eme2Q56A04 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Eme2Q56A04 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Eme2Q56A04 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Eme2Q56A04 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Eme2Q56A04 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Eme2Q56A04 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Eme2Q56A04 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Eme2Q56A04 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Eme2Q56A04 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Eme2Q56A04 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Eme2Q56A04 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Eme2Q56A04 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Eme2Q56A04 Aig1-202ENSMUST00000105534 617 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Eme2Q56A04 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Eme2Q56A04 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Eme2Q56A04 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Eme2Q56A04 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Eme2Q56A04 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Eme2Q56A04 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Eme2Q56A04 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Eme2Q56A04 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Eme2Q56A04 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Eme2Q56A04 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Eme2Q56A04 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Eme2Q56A04 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Eme2Q56A04 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Eme2Q56A04 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Eme2Q56A04 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Eme2Q56A04 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Eme2Q56A04 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Eme2Q56A04 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Eme2Q56A04 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Eme2Q56A04 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Eme2Q56A04 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Eme2Q56A04 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Eme2Q56A04 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Eme2Q56A04 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Eme2Q56A04 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Eme2Q56A04 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Eme2Q56A04 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Eme2Q56A04 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Eme2Q56A04 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Eme2Q56A04 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Eme2Q56A04 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Eme2Q56A04 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Eme2Q56A04 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Eme2Q56A04 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Eme2Q56A04 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Eme2Q56A04 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Eme2Q56A04 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Eme2Q56A04 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Eme2Q56A04 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Eme2Q56A04 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Eme2Q56A04 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Eme2Q56A04 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Eme2Q56A04 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Eme2Q56A04 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.2 ms