Protein–RNA interactions for Protein: Q52KF3

Spire1, Protein spire homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 598 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spire1Q52KF3 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Spire1Q52KF3 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Spire1Q52KF3 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Spire1Q52KF3 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Spire1Q52KF3 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Spire1Q52KF3 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Spire1Q52KF3 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Spire1Q52KF3 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Spire1Q52KF3 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Spire1Q52KF3 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Spire1Q52KF3 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Spire1Q52KF3 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Spire1Q52KF3 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Spire1Q52KF3 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Spire1Q52KF3 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Spire1Q52KF3 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Spire1Q52KF3 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Spire1Q52KF3 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Spire1Q52KF3 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Spire1Q52KF3 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Spire1Q52KF3 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Spire1Q52KF3 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Spire1Q52KF3 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Spire1Q52KF3 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Spire1Q52KF3 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Spire1Q52KF3 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Spire1Q52KF3 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Spire1Q52KF3 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Spire1Q52KF3 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Spire1Q52KF3 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Spire1Q52KF3 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Spire1Q52KF3 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Spire1Q52KF3 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Spire1Q52KF3 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Spire1Q52KF3 Chchd1-203ENSMUST00000224633 557 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Spire1Q52KF3 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Spire1Q52KF3 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Spire1Q52KF3 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Spire1Q52KF3 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Spire1Q52KF3 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Spire1Q52KF3 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Spire1Q52KF3 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Spire1Q52KF3 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Spire1Q52KF3 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Spire1Q52KF3 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Spire1Q52KF3 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Spire1Q52KF3 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Spire1Q52KF3 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Spire1Q52KF3 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Spire1Q52KF3 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Spire1Q52KF3 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Spire1Q52KF3 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Spire1Q52KF3 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Spire1Q52KF3 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Spire1Q52KF3 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Spire1Q52KF3 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Spire1Q52KF3 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Spire1Q52KF3 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Spire1Q52KF3 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Spire1Q52KF3 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Spire1Q52KF3 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Spire1Q52KF3 Gm11795-201ENSMUST00000127180 396 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Spire1Q52KF3 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Spire1Q52KF3 Med11-202ENSMUST00000151013 445 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Spire1Q52KF3 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Spire1Q52KF3 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Spire1Q52KF3 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Spire1Q52KF3 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Spire1Q52KF3 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Spire1Q52KF3 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Spire1Q52KF3 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Spire1Q52KF3 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Spire1Q52KF3 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Spire1Q52KF3 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Spire1Q52KF3 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Spire1Q52KF3 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Spire1Q52KF3 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Spire1Q52KF3 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Spire1Q52KF3 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Spire1Q52KF3 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Spire1Q52KF3 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Spire1Q52KF3 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Spire1Q52KF3 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Spire1Q52KF3 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Spire1Q52KF3 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Spire1Q52KF3 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Spire1Q52KF3 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Spire1Q52KF3 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Spire1Q52KF3 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Spire1Q52KF3 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Spire1Q52KF3 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Spire1Q52KF3 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Spire1Q52KF3 Hapln3-202ENSMUST00000205782 930 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Spire1Q52KF3 Gm44662-201ENSMUST00000206970 412 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Spire1Q52KF3 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Spire1Q52KF3 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Spire1Q52KF3 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Spire1Q52KF3 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Spire1Q52KF3 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Spire1Q52KF3 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.7 ms