Protein–RNA interactions for Protein: Q4ZJM7

Otol1, Otolin-1, mousemouse

Predictions only

Length 482 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Otol1Q4ZJM7 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Otol1Q4ZJM7 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Otol1Q4ZJM7 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Otol1Q4ZJM7 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Otol1Q4ZJM7 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Otol1Q4ZJM7 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Otol1Q4ZJM7 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Otol1Q4ZJM7 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Otol1Q4ZJM7 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Otol1Q4ZJM7 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Otol1Q4ZJM7 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Otol1Q4ZJM7 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Otol1Q4ZJM7 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Otol1Q4ZJM7 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Otol1Q4ZJM7 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Otol1Q4ZJM7 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Otol1Q4ZJM7 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Otol1Q4ZJM7 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Otol1Q4ZJM7 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Otol1Q4ZJM7 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Otol1Q4ZJM7 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Otol1Q4ZJM7 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Otol1Q4ZJM7 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Otol1Q4ZJM7 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Otol1Q4ZJM7 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Otol1Q4ZJM7 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Otol1Q4ZJM7 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Otol1Q4ZJM7 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Otol1Q4ZJM7 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Otol1Q4ZJM7 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Otol1Q4ZJM7 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Otol1Q4ZJM7 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Otol1Q4ZJM7 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Otol1Q4ZJM7 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Otol1Q4ZJM7 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Otol1Q4ZJM7 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Otol1Q4ZJM7 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Otol1Q4ZJM7 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Otol1Q4ZJM7 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Otol1Q4ZJM7 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Otol1Q4ZJM7 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Otol1Q4ZJM7 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Otol1Q4ZJM7 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Otol1Q4ZJM7 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Otol1Q4ZJM7 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Otol1Q4ZJM7 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Otol1Q4ZJM7 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Otol1Q4ZJM7 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Otol1Q4ZJM7 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Otol1Q4ZJM7 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Otol1Q4ZJM7 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Otol1Q4ZJM7 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Otol1Q4ZJM7 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Otol1Q4ZJM7 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Otol1Q4ZJM7 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Otol1Q4ZJM7 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Otol1Q4ZJM7 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Otol1Q4ZJM7 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Otol1Q4ZJM7 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Otol1Q4ZJM7 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Otol1Q4ZJM7 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Otol1Q4ZJM7 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Otol1Q4ZJM7 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Otol1Q4ZJM7 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Otol1Q4ZJM7 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Otol1Q4ZJM7 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Otol1Q4ZJM7 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Otol1Q4ZJM7 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Otol1Q4ZJM7 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Otol1Q4ZJM7 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Otol1Q4ZJM7 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Otol1Q4ZJM7 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Otol1Q4ZJM7 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Otol1Q4ZJM7 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Otol1Q4ZJM7 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Otol1Q4ZJM7 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Otol1Q4ZJM7 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Otol1Q4ZJM7 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Otol1Q4ZJM7 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Otol1Q4ZJM7 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Otol1Q4ZJM7 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Otol1Q4ZJM7 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Otol1Q4ZJM7 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Otol1Q4ZJM7 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Otol1Q4ZJM7 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Otol1Q4ZJM7 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Otol1Q4ZJM7 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Otol1Q4ZJM7 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Otol1Q4ZJM7 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Otol1Q4ZJM7 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Otol1Q4ZJM7 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Otol1Q4ZJM7 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Otol1Q4ZJM7 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Otol1Q4ZJM7 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Otol1Q4ZJM7 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Otol1Q4ZJM7 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Otol1Q4ZJM7 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Otol1Q4ZJM7 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Otol1Q4ZJM7 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Otol1Q4ZJM7 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 70.3 ms