Protein–RNA interactions for Protein: Q4VAA7

Snx33, Sorting nexin-33, mousemouse

Predictions only

Length 574 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx33Q4VAA7 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Snx33Q4VAA7 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Snx33Q4VAA7 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Snx33Q4VAA7 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Snx33Q4VAA7 Dlg4-201ENSMUST00000018700 3204 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Snx33Q4VAA7 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Snx33Q4VAA7 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Snx33Q4VAA7 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Snx33Q4VAA7 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Snx33Q4VAA7 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Snx33Q4VAA7 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Snx33Q4VAA7 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Snx33Q4VAA7 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Snx33Q4VAA7 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Snx33Q4VAA7 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Snx33Q4VAA7 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Snx33Q4VAA7 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Snx33Q4VAA7 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Snx33Q4VAA7 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Snx33Q4VAA7 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Snx33Q4VAA7 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Snx33Q4VAA7 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Snx33Q4VAA7 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Snx33Q4VAA7 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Snx33Q4VAA7 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Snx33Q4VAA7 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Snx33Q4VAA7 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Snx33Q4VAA7 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Snx33Q4VAA7 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Snx33Q4VAA7 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Snx33Q4VAA7 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Snx33Q4VAA7 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Snx33Q4VAA7 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Snx33Q4VAA7 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Snx33Q4VAA7 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Snx33Q4VAA7 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Snx33Q4VAA7 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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Snx33Q4VAA7 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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Snx33Q4VAA7 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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Snx33Q4VAA7 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Snx33Q4VAA7 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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Snx33Q4VAA7 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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Snx33Q4VAA7 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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Snx33Q4VAA7 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Snx33Q4VAA7 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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Snx33Q4VAA7 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Snx33Q4VAA7 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Snx33Q4VAA7 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Snx33Q4VAA7 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Snx33Q4VAA7 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Snx33Q4VAA7 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Snx33Q4VAA7 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Snx33Q4VAA7 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Snx33Q4VAA7 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Snx33Q4VAA7 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Snx33Q4VAA7 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Snx33Q4VAA7 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Snx33Q4VAA7 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Snx33Q4VAA7 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Snx33Q4VAA7 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Snx33Q4VAA7 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Snx33Q4VAA7 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Snx33Q4VAA7 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Snx33Q4VAA7 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Snx33Q4VAA7 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
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