Protein–RNA interactions for Protein: Q499D0

Foxn3, Forkhead box protein N3, mousemouse

Predictions only

Length 457 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Foxn3Q499D0 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Foxn3Q499D0 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Foxn3Q499D0 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Foxn3Q499D0 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Foxn3Q499D0 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Foxn3Q499D0 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Foxn3Q499D0 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Foxn3Q499D0 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Foxn3Q499D0 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Foxn3Q499D0 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Foxn3Q499D0 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Foxn3Q499D0 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Foxn3Q499D0 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Foxn3Q499D0 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Foxn3Q499D0 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Foxn3Q499D0 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Foxn3Q499D0 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Foxn3Q499D0 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Foxn3Q499D0 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Foxn3Q499D0 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Foxn3Q499D0 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Foxn3Q499D0 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Foxn3Q499D0 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Foxn3Q499D0 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Foxn3Q499D0 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Foxn3Q499D0 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Foxn3Q499D0 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Foxn3Q499D0 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Foxn3Q499D0 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Foxn3Q499D0 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Foxn3Q499D0 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Foxn3Q499D0 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Foxn3Q499D0 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Foxn3Q499D0 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Foxn3Q499D0 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Foxn3Q499D0 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Foxn3Q499D0 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Foxn3Q499D0 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Foxn3Q499D0 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Foxn3Q499D0 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Foxn3Q499D0 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Foxn3Q499D0 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Foxn3Q499D0 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Foxn3Q499D0 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Foxn3Q499D0 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Foxn3Q499D0 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Foxn3Q499D0 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Foxn3Q499D0 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Foxn3Q499D0 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Foxn3Q499D0 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Foxn3Q499D0 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Foxn3Q499D0 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Foxn3Q499D0 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Foxn3Q499D0 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Foxn3Q499D0 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Foxn3Q499D0 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Foxn3Q499D0 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Foxn3Q499D0 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Foxn3Q499D0 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Foxn3Q499D0 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Foxn3Q499D0 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Foxn3Q499D0 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Foxn3Q499D0 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Foxn3Q499D0 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Foxn3Q499D0 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Foxn3Q499D0 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Foxn3Q499D0 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Foxn3Q499D0 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Foxn3Q499D0 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Foxn3Q499D0 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Foxn3Q499D0 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Foxn3Q499D0 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Foxn3Q499D0 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Foxn3Q499D0 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Foxn3Q499D0 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Foxn3Q499D0 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Foxn3Q499D0 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Foxn3Q499D0 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Foxn3Q499D0 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Foxn3Q499D0 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Foxn3Q499D0 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Foxn3Q499D0 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Foxn3Q499D0 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Foxn3Q499D0 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Foxn3Q499D0 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Foxn3Q499D0 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Foxn3Q499D0 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Foxn3Q499D0 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Foxn3Q499D0 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Foxn3Q499D0 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Foxn3Q499D0 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Foxn3Q499D0 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Foxn3Q499D0 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Foxn3Q499D0 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Foxn3Q499D0 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Foxn3Q499D0 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Foxn3Q499D0 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Foxn3Q499D0 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Foxn3Q499D0 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Foxn3Q499D0 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.8 ms