Protein–RNA interactions for Protein: Q497I4

Krt35, Keratin, type I cuticular Ha5, mousemouse

Predictions only

Length 455 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt35Q497I4 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Krt35Q497I4 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Krt35Q497I4 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Krt35Q497I4 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Krt35Q497I4 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Krt35Q497I4 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Krt35Q497I4 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Krt35Q497I4 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Krt35Q497I4 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Krt35Q497I4 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Krt35Q497I4 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Krt35Q497I4 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Krt35Q497I4 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Krt35Q497I4 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Krt35Q497I4 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Krt35Q497I4 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Krt35Q497I4 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Krt35Q497I4 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Krt35Q497I4 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Krt35Q497I4 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Krt35Q497I4 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Krt35Q497I4 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Krt35Q497I4 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Krt35Q497I4 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Krt35Q497I4 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Krt35Q497I4 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Krt35Q497I4 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Krt35Q497I4 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Krt35Q497I4 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Krt35Q497I4 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Krt35Q497I4 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Krt35Q497I4 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Krt35Q497I4 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Krt35Q497I4 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Krt35Q497I4 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Krt35Q497I4 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Krt35Q497I4 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Krt35Q497I4 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Krt35Q497I4 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Krt35Q497I4 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Krt35Q497I4 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Krt35Q497I4 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Krt35Q497I4 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Krt35Q497I4 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Krt35Q497I4 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Krt35Q497I4 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Krt35Q497I4 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Krt35Q497I4 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Krt35Q497I4 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Krt35Q497I4 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Krt35Q497I4 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Krt35Q497I4 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Krt35Q497I4 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Krt35Q497I4 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Krt35Q497I4 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Krt35Q497I4 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Krt35Q497I4 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Krt35Q497I4 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Krt35Q497I4 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Krt35Q497I4 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Krt35Q497I4 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Krt35Q497I4 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Krt35Q497I4 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Krt35Q497I4 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Krt35Q497I4 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Krt35Q497I4 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Krt35Q497I4 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Krt35Q497I4 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Krt35Q497I4 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Krt35Q497I4 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Krt35Q497I4 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Krt35Q497I4 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Krt35Q497I4 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Krt35Q497I4 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Krt35Q497I4 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Krt35Q497I4 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Krt35Q497I4 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Krt35Q497I4 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Krt35Q497I4 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Krt35Q497I4 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Krt35Q497I4 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Krt35Q497I4 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Krt35Q497I4 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Krt35Q497I4 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Krt35Q497I4 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Krt35Q497I4 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Krt35Q497I4 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Krt35Q497I4 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Krt35Q497I4 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Krt35Q497I4 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Krt35Q497I4 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Krt35Q497I4 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Krt35Q497I4 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Krt35Q497I4 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Krt35Q497I4 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Krt35Q497I4 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Krt35Q497I4 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Krt35Q497I4 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Krt35Q497I4 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Krt35Q497I4 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.1 ms