Protein–RNA interactions for Protein: Q3V1H1

Ckap2, Cytoskeleton-associated protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 664 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ckap2Q3V1H1 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ckap2Q3V1H1 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ckap2Q3V1H1 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ckap2Q3V1H1 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ckap2Q3V1H1 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ckap2Q3V1H1 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ckap2Q3V1H1 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Ckap2Q3V1H1 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ckap2Q3V1H1 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ckap2Q3V1H1 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Ckap2Q3V1H1 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ckap2Q3V1H1 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ckap2Q3V1H1 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ckap2Q3V1H1 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ckap2Q3V1H1 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ckap2Q3V1H1 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ckap2Q3V1H1 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ckap2Q3V1H1 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ckap2Q3V1H1 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ckap2Q3V1H1 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ckap2Q3V1H1 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ckap2Q3V1H1 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ckap2Q3V1H1 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ckap2Q3V1H1 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Ckap2Q3V1H1 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ckap2Q3V1H1 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ckap2Q3V1H1 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ckap2Q3V1H1 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ckap2Q3V1H1 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ckap2Q3V1H1 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ckap2Q3V1H1 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ckap2Q3V1H1 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ckap2Q3V1H1 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ckap2Q3V1H1 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ckap2Q3V1H1 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ckap2Q3V1H1 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ckap2Q3V1H1 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ckap2Q3V1H1 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ckap2Q3V1H1 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Ckap2Q3V1H1 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ckap2Q3V1H1 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Ckap2Q3V1H1 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ckap2Q3V1H1 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ckap2Q3V1H1 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ckap2Q3V1H1 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Ckap2Q3V1H1 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ckap2Q3V1H1 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ckap2Q3V1H1 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ckap2Q3V1H1 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ckap2Q3V1H1 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ckap2Q3V1H1 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ckap2Q3V1H1 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ckap2Q3V1H1 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ckap2Q3V1H1 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ckap2Q3V1H1 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ckap2Q3V1H1 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ckap2Q3V1H1 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ckap2Q3V1H1 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ckap2Q3V1H1 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ckap2Q3V1H1 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ckap2Q3V1H1 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ckap2Q3V1H1 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ckap2Q3V1H1 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ckap2Q3V1H1 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ckap2Q3V1H1 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ckap2Q3V1H1 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Ckap2Q3V1H1 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Ckap2Q3V1H1 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ckap2Q3V1H1 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ckap2Q3V1H1 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ckap2Q3V1H1 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Ckap2Q3V1H1 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ckap2Q3V1H1 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ckap2Q3V1H1 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ckap2Q3V1H1 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ckap2Q3V1H1 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ckap2Q3V1H1 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ckap2Q3V1H1 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ckap2Q3V1H1 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ckap2Q3V1H1 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ckap2Q3V1H1 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ckap2Q3V1H1 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ckap2Q3V1H1 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ckap2Q3V1H1 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ckap2Q3V1H1 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ckap2Q3V1H1 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ckap2Q3V1H1 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ckap2Q3V1H1 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ckap2Q3V1H1 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ckap2Q3V1H1 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ckap2Q3V1H1 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ckap2Q3V1H1 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Ckap2Q3V1H1 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ckap2Q3V1H1 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ckap2Q3V1H1 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ckap2Q3V1H1 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Ckap2Q3V1H1 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ckap2Q3V1H1 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ckap2Q3V1H1 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ckap2Q3V1H1 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34 ms