Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0Y1

Ppp4r3c, Protein PPP4R3C, mousemouse

Predictions only

Length 813 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppp4r3cQ3V0Y1 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ppp4r3cQ3V0Y1 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Ppp4r3cQ3V0Y1 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ppp4r3cQ3V0Y1 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ppp4r3cQ3V0Y1 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ppp4r3cQ3V0Y1 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ppp4r3cQ3V0Y1 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ppp4r3cQ3V0Y1 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ppp4r3cQ3V0Y1 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ppp4r3cQ3V0Y1 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Ppp4r3cQ3V0Y1 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ppp4r3cQ3V0Y1 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ppp4r3cQ3V0Y1 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ppp4r3cQ3V0Y1 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ppp4r3cQ3V0Y1 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ppp4r3cQ3V0Y1 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ppp4r3cQ3V0Y1 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ppp4r3cQ3V0Y1 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ppp4r3cQ3V0Y1 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ppp4r3cQ3V0Y1 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ppp4r3cQ3V0Y1 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ppp4r3cQ3V0Y1 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ppp4r3cQ3V0Y1 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ppp4r3cQ3V0Y1 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ppp4r3cQ3V0Y1 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Ppp4r3cQ3V0Y1 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ppp4r3cQ3V0Y1 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Ppp4r3cQ3V0Y1 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ppp4r3cQ3V0Y1 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ppp4r3cQ3V0Y1 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ppp4r3cQ3V0Y1 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ppp4r3cQ3V0Y1 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ppp4r3cQ3V0Y1 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ppp4r3cQ3V0Y1 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Ppp4r3cQ3V0Y1 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ppp4r3cQ3V0Y1 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ppp4r3cQ3V0Y1 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ppp4r3cQ3V0Y1 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ppp4r3cQ3V0Y1 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ppp4r3cQ3V0Y1 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ppp4r3cQ3V0Y1 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ppp4r3cQ3V0Y1 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ppp4r3cQ3V0Y1 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ppp4r3cQ3V0Y1 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ppp4r3cQ3V0Y1 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ppp4r3cQ3V0Y1 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ppp4r3cQ3V0Y1 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ppp4r3cQ3V0Y1 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ppp4r3cQ3V0Y1 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ppp4r3cQ3V0Y1 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ppp4r3cQ3V0Y1 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ppp4r3cQ3V0Y1 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ppp4r3cQ3V0Y1 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ppp4r3cQ3V0Y1 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ppp4r3cQ3V0Y1 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ppp4r3cQ3V0Y1 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ppp4r3cQ3V0Y1 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ppp4r3cQ3V0Y1 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ppp4r3cQ3V0Y1 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ppp4r3cQ3V0Y1 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ppp4r3cQ3V0Y1 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Ppp4r3cQ3V0Y1 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Ppp4r3cQ3V0Y1 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Ppp4r3cQ3V0Y1 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Ppp4r3cQ3V0Y1 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Ppp4r3cQ3V0Y1 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Ppp4r3cQ3V0Y1 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Ppp4r3cQ3V0Y1 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Ppp4r3cQ3V0Y1 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ppp4r3cQ3V0Y1 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ppp4r3cQ3V0Y1 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ppp4r3cQ3V0Y1 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ppp4r3cQ3V0Y1 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ppp4r3cQ3V0Y1 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ppp4r3cQ3V0Y1 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ppp4r3cQ3V0Y1 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
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Ppp4r3cQ3V0Y1 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
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Ppp4r3cQ3V0Y1 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ppp4r3cQ3V0Y1 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ppp4r3cQ3V0Y1 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ppp4r3cQ3V0Y1 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ppp4r3cQ3V0Y1 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Ppp4r3cQ3V0Y1 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ppp4r3cQ3V0Y1 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ppp4r3cQ3V0Y1 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ppp4r3cQ3V0Y1 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ppp4r3cQ3V0Y1 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ppp4r3cQ3V0Y1 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Ppp4r3cQ3V0Y1 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ppp4r3cQ3V0Y1 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ppp4r3cQ3V0Y1 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ppp4r3cQ3V0Y1 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ppp4r3cQ3V0Y1 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ppp4r3cQ3V0Y1 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ppp4r3cQ3V0Y1 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ppp4r3cQ3V0Y1 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ppp4r3cQ3V0Y1 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ppp4r3cQ3V0Y1 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
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