Protein–RNA interactions for Protein: Q3V009

Tmed1, Transmembrane emp24 domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmed1Q3V009 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tmed1Q3V009 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tmed1Q3V009 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tmed1Q3V009 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Tmed1Q3V009 Tsc2-221ENSMUST00000228412 5432 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tmed1Q3V009 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Tmed1Q3V009 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tmed1Q3V009 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tmed1Q3V009 Eaf1-201ENSMUST00000022446 4918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tmed1Q3V009 Scn4b-201ENSMUST00000060125 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tmed1Q3V009 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Tmed1Q3V009 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tmed1Q3V009 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tmed1Q3V009 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tmed1Q3V009 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tmed1Q3V009 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tmed1Q3V009 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Tmed1Q3V009 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tmed1Q3V009 Zmym4-201ENSMUST00000106108 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tmed1Q3V009 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tmed1Q3V009 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tmed1Q3V009 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tmed1Q3V009 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tmed1Q3V009 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tmed1Q3V009 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tmed1Q3V009 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tmed1Q3V009 Satb2-201ENSMUST00000042857 6277 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tmed1Q3V009 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tmed1Q3V009 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tmed1Q3V009 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tmed1Q3V009 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tmed1Q3V009 Grin3a-201ENSMUST00000076674 7431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tmed1Q3V009 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Tmed1Q3V009 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Tmed1Q3V009 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tmed1Q3V009 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tmed1Q3V009 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Tmed1Q3V009 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tmed1Q3V009 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Tmed1Q3V009 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tmed1Q3V009 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Tmed1Q3V009 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Tmed1Q3V009 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tmed1Q3V009 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tmed1Q3V009 Klhdc8b-207ENSMUST00000193286 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tmed1Q3V009 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tmed1Q3V009 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tmed1Q3V009 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tmed1Q3V009 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tmed1Q3V009 Cacna2d1-205ENSMUST00000167946 7436 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tmed1Q3V009 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tmed1Q3V009 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tmed1Q3V009 Mypopos-202ENSMUST00000205975 2321 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Tmed1Q3V009 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tmed1Q3V009 Pcgf5-211ENSMUST00000225920 6443 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Tmed1Q3V009 Tbc1d4-209ENSMUST00000161991 6483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tmed1Q3V009 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tmed1Q3V009 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tmed1Q3V009 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tmed1Q3V009 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tmed1Q3V009 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tmed1Q3V009 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tmed1Q3V009 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Tmed1Q3V009 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tmed1Q3V009 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tmed1Q3V009 Gpr155-202ENSMUST00000076463 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tmed1Q3V009 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Tmed1Q3V009 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tmed1Q3V009 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tmed1Q3V009 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tmed1Q3V009 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tmed1Q3V009 Ints3-202ENSMUST00000071488 4038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tmed1Q3V009 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Tmed1Q3V009 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tmed1Q3V009 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tmed1Q3V009 Cd72-202ENSMUST00000098104 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tmed1Q3V009 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tmed1Q3V009 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tmed1Q3V009 Slc4a4-207ENSMUST00000148750 7931 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tmed1Q3V009 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tmed1Q3V009 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tmed1Q3V009 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tmed1Q3V009 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tmed1Q3V009 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tmed1Q3V009 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tmed1Q3V009 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tmed1Q3V009 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tmed1Q3V009 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tmed1Q3V009 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tmed1Q3V009 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tmed1Q3V009 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tmed1Q3V009 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tmed1Q3V009 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tmed1Q3V009 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tmed1Q3V009 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tmed1Q3V009 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tmed1Q3V009 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tmed1Q3V009 Gpr88-201ENSMUST00000090473 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tmed1Q3V009 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tmed1Q3V009 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.7 ms