Protein–RNA interactions for Protein: Q3UW98

Clca4b, Chloride channel accessory 4B, mousemouse

Predictions only

Length 925 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clca4bQ3UW98 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Clca4bQ3UW98 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Clca4bQ3UW98 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Clca4bQ3UW98 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Clca4bQ3UW98 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Clca4bQ3UW98 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Clca4bQ3UW98 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Clca4bQ3UW98 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Clca4bQ3UW98 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Clca4bQ3UW98 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Clca4bQ3UW98 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Clca4bQ3UW98 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Clca4bQ3UW98 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Clca4bQ3UW98 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Clca4bQ3UW98 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Clca4bQ3UW98 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Clca4bQ3UW98 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Clca4bQ3UW98 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Clca4bQ3UW98 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Clca4bQ3UW98 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Clca4bQ3UW98 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Clca4bQ3UW98 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Clca4bQ3UW98 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Clca4bQ3UW98 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Clca4bQ3UW98 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Clca4bQ3UW98 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Clca4bQ3UW98 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Clca4bQ3UW98 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Clca4bQ3UW98 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Clca4bQ3UW98 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Clca4bQ3UW98 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Clca4bQ3UW98 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Clca4bQ3UW98 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Clca4bQ3UW98 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Clca4bQ3UW98 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Clca4bQ3UW98 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Clca4bQ3UW98 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Clca4bQ3UW98 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Clca4bQ3UW98 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Clca4bQ3UW98 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Clca4bQ3UW98 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Clca4bQ3UW98 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Clca4bQ3UW98 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Clca4bQ3UW98 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Clca4bQ3UW98 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Clca4bQ3UW98 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Clca4bQ3UW98 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Clca4bQ3UW98 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Clca4bQ3UW98 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Clca4bQ3UW98 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Clca4bQ3UW98 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Clca4bQ3UW98 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Clca4bQ3UW98 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Clca4bQ3UW98 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Clca4bQ3UW98 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Clca4bQ3UW98 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Clca4bQ3UW98 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Clca4bQ3UW98 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Clca4bQ3UW98 Stard3nl-209ENSMUST00000221380 1268 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Clca4bQ3UW98 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Clca4bQ3UW98 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Clca4bQ3UW98 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Clca4bQ3UW98 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Clca4bQ3UW98 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Clca4bQ3UW98 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Clca4bQ3UW98 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Clca4bQ3UW98 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Clca4bQ3UW98 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Clca4bQ3UW98 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Clca4bQ3UW98 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Clca4bQ3UW98 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Clca4bQ3UW98 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Clca4bQ3UW98 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Clca4bQ3UW98 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Clca4bQ3UW98 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Clca4bQ3UW98 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Clca4bQ3UW98 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Clca4bQ3UW98 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Clca4bQ3UW98 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Clca4bQ3UW98 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Clca4bQ3UW98 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Clca4bQ3UW98 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Clca4bQ3UW98 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Clca4bQ3UW98 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Clca4bQ3UW98 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Clca4bQ3UW98 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Clca4bQ3UW98 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Clca4bQ3UW98 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Clca4bQ3UW98 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Clca4bQ3UW98 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Clca4bQ3UW98 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Clca4bQ3UW98 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Clca4bQ3UW98 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Clca4bQ3UW98 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Clca4bQ3UW98 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Clca4bQ3UW98 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Clca4bQ3UW98 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Clca4bQ3UW98 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Clca4bQ3UW98 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Clca4bQ3UW98 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.1 ms