Protein–RNA interactions for Protein: Q3UW12

Cnga4, Cyclic nucleotide-gated cation channel alpha-4, mousemouse

Predictions only

Length 575 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnga4Q3UW12 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cnga4Q3UW12 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cnga4Q3UW12 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cnga4Q3UW12 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cnga4Q3UW12 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cnga4Q3UW12 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cnga4Q3UW12 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cnga4Q3UW12 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cnga4Q3UW12 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cnga4Q3UW12 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cnga4Q3UW12 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cnga4Q3UW12 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cnga4Q3UW12 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cnga4Q3UW12 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cnga4Q3UW12 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cnga4Q3UW12 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cnga4Q3UW12 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cnga4Q3UW12 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cnga4Q3UW12 Pcsk5-201ENSMUST00000025618 6675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cnga4Q3UW12 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cnga4Q3UW12 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cnga4Q3UW12 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cnga4Q3UW12 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cnga4Q3UW12 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cnga4Q3UW12 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cnga4Q3UW12 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cnga4Q3UW12 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cnga4Q3UW12 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cnga4Q3UW12 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cnga4Q3UW12 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cnga4Q3UW12 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cnga4Q3UW12 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cnga4Q3UW12 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cnga4Q3UW12 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cnga4Q3UW12 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Cnga4Q3UW12 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cnga4Q3UW12 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cnga4Q3UW12 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cnga4Q3UW12 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cnga4Q3UW12 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cnga4Q3UW12 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cnga4Q3UW12 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cnga4Q3UW12 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Cnga4Q3UW12 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cnga4Q3UW12 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cnga4Q3UW12 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cnga4Q3UW12 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Cnga4Q3UW12 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Cnga4Q3UW12 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Cnga4Q3UW12 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Cnga4Q3UW12 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Cnga4Q3UW12 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cnga4Q3UW12 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cnga4Q3UW12 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cnga4Q3UW12 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Cnga4Q3UW12 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Cnga4Q3UW12 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Cnga4Q3UW12 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cnga4Q3UW12 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cnga4Q3UW12 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cnga4Q3UW12 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cnga4Q3UW12 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cnga4Q3UW12 Fancm-201ENSMUST00000058889 7775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cnga4Q3UW12 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Cnga4Q3UW12 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cnga4Q3UW12 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cnga4Q3UW12 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Cnga4Q3UW12 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cnga4Q3UW12 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cnga4Q3UW12 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cnga4Q3UW12 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cnga4Q3UW12 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cnga4Q3UW12 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cnga4Q3UW12 Trank1-201ENSMUST00000078626 10520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cnga4Q3UW12 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cnga4Q3UW12 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cnga4Q3UW12 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cnga4Q3UW12 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cnga4Q3UW12 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cnga4Q3UW12 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cnga4Q3UW12 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cnga4Q3UW12 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cnga4Q3UW12 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Cnga4Q3UW12 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Cnga4Q3UW12 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cnga4Q3UW12 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cnga4Q3UW12 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cnga4Q3UW12 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Cnga4Q3UW12 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cnga4Q3UW12 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cnga4Q3UW12 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cnga4Q3UW12 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cnga4Q3UW12 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cnga4Q3UW12 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cnga4Q3UW12 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cnga4Q3UW12 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cnga4Q3UW12 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cnga4Q3UW12 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cnga4Q3UW12 Tmem2-201ENSMUST00000025663 6585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cnga4Q3UW12 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30 ms