Protein–RNA interactions for Protein: Q3USZ2

Ubtfl1, Upstream-binding factor 1-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 394 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubtfl1Q3USZ2 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ubtfl1Q3USZ2 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ubtfl1Q3USZ2 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ubtfl1Q3USZ2 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ubtfl1Q3USZ2 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ubtfl1Q3USZ2 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ubtfl1Q3USZ2 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ubtfl1Q3USZ2 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ubtfl1Q3USZ2 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ubtfl1Q3USZ2 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ubtfl1Q3USZ2 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ubtfl1Q3USZ2 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ubtfl1Q3USZ2 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ubtfl1Q3USZ2 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Ubtfl1Q3USZ2 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ubtfl1Q3USZ2 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ubtfl1Q3USZ2 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ubtfl1Q3USZ2 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ubtfl1Q3USZ2 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ubtfl1Q3USZ2 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ubtfl1Q3USZ2 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ubtfl1Q3USZ2 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ubtfl1Q3USZ2 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ubtfl1Q3USZ2 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ubtfl1Q3USZ2 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ubtfl1Q3USZ2 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ubtfl1Q3USZ2 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ubtfl1Q3USZ2 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Ubtfl1Q3USZ2 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Ubtfl1Q3USZ2 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Ubtfl1Q3USZ2 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ubtfl1Q3USZ2 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ubtfl1Q3USZ2 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ubtfl1Q3USZ2 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ubtfl1Q3USZ2 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ubtfl1Q3USZ2 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ubtfl1Q3USZ2 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ubtfl1Q3USZ2 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ubtfl1Q3USZ2 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ubtfl1Q3USZ2 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Ubtfl1Q3USZ2 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ubtfl1Q3USZ2 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ubtfl1Q3USZ2 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ubtfl1Q3USZ2 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ubtfl1Q3USZ2 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ubtfl1Q3USZ2 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ubtfl1Q3USZ2 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ubtfl1Q3USZ2 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ubtfl1Q3USZ2 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ubtfl1Q3USZ2 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ubtfl1Q3USZ2 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ubtfl1Q3USZ2 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ubtfl1Q3USZ2 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Ubtfl1Q3USZ2 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ubtfl1Q3USZ2 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ubtfl1Q3USZ2 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ubtfl1Q3USZ2 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ubtfl1Q3USZ2 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Ubtfl1Q3USZ2 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ubtfl1Q3USZ2 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ubtfl1Q3USZ2 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ubtfl1Q3USZ2 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ubtfl1Q3USZ2 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ubtfl1Q3USZ2 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ubtfl1Q3USZ2 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ubtfl1Q3USZ2 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ubtfl1Q3USZ2 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
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Ubtfl1Q3USZ2 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Ubtfl1Q3USZ2 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ubtfl1Q3USZ2 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ubtfl1Q3USZ2 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ubtfl1Q3USZ2 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ubtfl1Q3USZ2 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ubtfl1Q3USZ2 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ubtfl1Q3USZ2 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ubtfl1Q3USZ2 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ubtfl1Q3USZ2 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ubtfl1Q3USZ2 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ubtfl1Q3USZ2 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ubtfl1Q3USZ2 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ubtfl1Q3USZ2 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ubtfl1Q3USZ2 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ubtfl1Q3USZ2 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ubtfl1Q3USZ2 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ubtfl1Q3USZ2 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ubtfl1Q3USZ2 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ubtfl1Q3USZ2 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ubtfl1Q3USZ2 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ubtfl1Q3USZ2 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ubtfl1Q3USZ2 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ubtfl1Q3USZ2 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ubtfl1Q3USZ2 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ubtfl1Q3USZ2 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ubtfl1Q3USZ2 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ubtfl1Q3USZ2 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Ubtfl1Q3USZ2 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Ubtfl1Q3USZ2 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.7 ms