Protein–RNA interactions for Protein: Q3US59

Gm28047, Predicted gene, 28047, mousemouse

Predictions only

Length 414 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm28047Q3US59 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gm28047Q3US59 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gm28047Q3US59 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Gm28047Q3US59 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gm28047Q3US59 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gm28047Q3US59 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gm28047Q3US59 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gm28047Q3US59 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gm28047Q3US59 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gm28047Q3US59 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gm28047Q3US59 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gm28047Q3US59 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gm28047Q3US59 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gm28047Q3US59 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gm28047Q3US59 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gm28047Q3US59 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gm28047Q3US59 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gm28047Q3US59 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gm28047Q3US59 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gm28047Q3US59 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Gm28047Q3US59 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gm28047Q3US59 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gm28047Q3US59 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
Gm28047Q3US59 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Gm28047Q3US59 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Gm28047Q3US59 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Gm28047Q3US59 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gm28047Q3US59 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gm28047Q3US59 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Gm28047Q3US59 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gm28047Q3US59 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gm28047Q3US59 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gm28047Q3US59 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gm28047Q3US59 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Gm28047Q3US59 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gm28047Q3US59 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Gm28047Q3US59 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gm28047Q3US59 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Gm28047Q3US59 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gm28047Q3US59 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gm28047Q3US59 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gm28047Q3US59 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gm28047Q3US59 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gm28047Q3US59 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gm28047Q3US59 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gm28047Q3US59 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gm28047Q3US59 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gm28047Q3US59 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Gm28047Q3US59 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gm28047Q3US59 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gm28047Q3US59 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gm28047Q3US59 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gm28047Q3US59 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gm28047Q3US59 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gm28047Q3US59 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gm28047Q3US59 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gm28047Q3US59 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gm28047Q3US59 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gm28047Q3US59 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gm28047Q3US59 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gm28047Q3US59 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gm28047Q3US59 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gm28047Q3US59 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gm28047Q3US59 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gm28047Q3US59 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gm28047Q3US59 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gm28047Q3US59 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gm28047Q3US59 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gm28047Q3US59 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gm28047Q3US59 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gm28047Q3US59 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gm28047Q3US59 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gm28047Q3US59 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gm28047Q3US59 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gm28047Q3US59 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gm28047Q3US59 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Gm28047Q3US59 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gm28047Q3US59 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gm28047Q3US59 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gm28047Q3US59 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gm28047Q3US59 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gm28047Q3US59 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gm28047Q3US59 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gm28047Q3US59 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gm28047Q3US59 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gm28047Q3US59 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gm28047Q3US59 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gm28047Q3US59 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gm28047Q3US59 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gm28047Q3US59 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gm28047Q3US59 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gm28047Q3US59 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gm28047Q3US59 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gm28047Q3US59 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gm28047Q3US59 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gm28047Q3US59 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gm28047Q3US59 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gm28047Q3US59 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gm28047Q3US59 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gm28047Q3US59 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.5 ms