Protein–RNA interactions for Protein: Q3US17

Znf48, Zinc finger protein 48, mousemouse

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Length 591 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Znf48Q3US17 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
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Znf48Q3US17 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Znf48Q3US17 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Znf48Q3US17 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Znf48Q3US17 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Znf48Q3US17 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Znf48Q3US17 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Znf48Q3US17 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Znf48Q3US17 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Znf48Q3US17 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Znf48Q3US17 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Znf48Q3US17 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Znf48Q3US17 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Znf48Q3US17 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Znf48Q3US17 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Znf48Q3US17 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Znf48Q3US17 Sirpa-202ENSMUST00000099113 3342 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Znf48Q3US17 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.9 ms